RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368780.3

LCE2B-201, Transcript of late cornified envelope 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCE2B, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE2B-201ENST00000368780 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.93■■■□□ 2.54
LCE2B-201ENST00000368780 PREX2Q70Z35 1606 aa30.91■■■□□ 2.54
LCE2B-201ENST00000368780 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.9■■■□□ 2.54
LCE2B-201ENST00000368780 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.9■■■□□ 2.54
LCE2B-201ENST00000368780 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.87■■■□□ 2.53
LCE2B-201ENST00000368780 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.87■■■□□ 2.53
LCE2B-201ENST00000368780 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.86■■■□□ 2.53
LCE2B-201ENST00000368780 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.84■■■□□ 2.53
LCE2B-201ENST00000368780 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.84■■■□□ 2.53
LCE2B-201ENST00000368780 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.82■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.79■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.79■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.79■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.78■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 ABCC1P33527 1531 aa30.78■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 TIAM1Q13009 1591 aa30.77■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
LCE2B-201ENST00000368780 AFAP1Q8N556 730 aa30.75■■■□□ 2.51
LCE2B-201ENST00000368780 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
LCE2B-201ENST00000368780 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.72■■■□□ 2.51
LCE2B-201ENST00000368780 KDM5CP41229 1560 aa30.71■■■□□ 2.51
LCE2B-201ENST00000368780 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.7■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.7■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.69■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.69■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.66■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.66■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 NCOA2Q15596 1464 aa30.65■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.64■■■□□ 2.5
LCE2B-201ENST00000368780 ATP10AO60312 1499 aa30.63■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.63■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.61■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.61■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 MAP3K1Q13233 1512 aa30.61■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.61■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.61■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.6■■■□□ 2.49
LCE2B-201ENST00000368780 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.57■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.57■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 MADDQ8WXG6 1647 aa30.55■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 APLP2Q06481 763 aa30.55■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 ABCA6Q8N139 1617 aa30.55■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 MLECQ14165 292 aa30.54■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 PTPRMP28827 1452 aa30.51■■■□□ 2.48
LCE2B-201ENST00000368780 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
LCE2B-201ENST00000368780 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.49■■■□□ 2.47
LCE2B-201ENST00000368780 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.47■■■□□ 2.47
LCE2B-201ENST00000368780 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
LCE2B-201ENST00000368780 REREQ9P2R6 1566 aa30.45■■■□□ 2.47
LCE2B-201ENST00000368780 ATP7AQ04656 1500 aa30.45■■■□□ 2.47
LCE2B-201ENST00000368780 MBD5Q9P267 1494 aa30.44■■■□□ 2.46
LCE2B-201ENST00000368780 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
LCE2B-201ENST00000368780 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.39■■■□□ 2.45
LCE2B-201ENST00000368780 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.38■■■□□ 2.45
LCE2B-201ENST00000368780 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.37■■■□□ 2.45
LCE2B-201ENST00000368780 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.37■■■□□ 2.45
LCE2B-201ENST00000368780 AGLP35573 1532 aa30.37■■■□□ 2.45
LCE2B-201ENST00000368780 MIA2Q96PC5 1412 aa30.31■■■□□ 2.44
LCE2B-201ENST00000368780 A2MP01023 1474 aa30.31■■■□□ 2.44
LCE2B-201ENST00000368780 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.29■■■□□ 2.44
LCE2B-201ENST00000368780 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.29■■■□□ 2.44
LCE2B-201ENST00000368780 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.28■■■□□ 2.44
LCE2B-201ENST00000368780 PLXNC1O60486 1568 aa30.27■■■□□ 2.44
LCE2B-201ENST00000368780 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.25■■■□□ 2.43
LCE2B-201ENST00000368780 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
LCE2B-201ENST00000368780 TSPY4P0CV99 314 aa30.22■■■□□ 2.43
LCE2B-201ENST00000368780 TSPY10P0CW01 314 aa30.22■■■□□ 2.43
LCE2B-201ENST00000368780 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.18■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.18■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.14■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.14■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 GGT6Q6P531 493 aa30.14■■■□□ 2.42
LCE2B-201ENST00000368780 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.12■■■□□ 2.41
LCE2B-201ENST00000368780 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
LCE2B-201ENST00000368780 C3P01024 1663 aa30.08■■■□□ 2.41
LCE2B-201ENST00000368780 KIF3BO15066 747 aa30.07■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 ABCC5O15440 1437 aa30.05■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.04■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.04■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 DAPK1P53355 1430 aa30.04■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 MROH2AA6NES4 1674 aa30.03■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 HSPA2P54652 639 aa30.02■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 ZMYM3Q14202 1370 aa30.02■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.01■■■□□ 2.4
LCE2B-201ENST00000368780 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
LCE2B-201ENST00000368780 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
LCE2B-201ENST00000368780 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.99■■■□□ 2.39
LCE2B-201ENST00000368780 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.98■■■□□ 2.39
LCE2B-201ENST00000368780 KIF15Q9NS87 1388 aa29.96■■■□□ 2.39
LCE2B-201ENST00000368780 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms