RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 ABCC5O15440 1437 aa24.17■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 MIA2Q96PC5 1412 aa24.16■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 DAPK1P53355 1430 aa24.16■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 ANP32CO43423 234 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 KIF14Q15058 1648 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC13-202ENST00000366662 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 NUP160Q12769 1436 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 BCANQ96GW7 911 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TTC13-202ENST00000366662 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 ATP10BO94823 1461 aa23.97■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.97■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.96■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 PKD2Q13563 968 aa23.96■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 AKNAQ7Z591 1439 aa23.96■■□□□ 1.43
TTC13-202ENST00000366662 NCOA1Q15788 1441 aa23.94■■□□□ 1.42
TTC13-202ENST00000366662 BCL11AQ9H165 835 aa23.93■■□□□ 1.42
TTC13-202ENST00000366662 ROCK1Q13464 1354 aa23.93■■□□□ 1.42
TTC13-202ENST00000366662 PTPRGP23470 1445 aa23.93■■□□□ 1.42
TTC13-202ENST00000366662 CCDC184Q52MB2 194 aa23.89■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 TSPY4P0CV99 314 aa23.87■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 TSPY10P0CW01 314 aa23.87■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.87■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 PZPP20742 1482 aa23.85■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 NUP155O75694 1391 aa23.84■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 FKBP8Q14318 412 aa23.84■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.83■■□□□ 1.41
TTC13-202ENST00000366662 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 CCER2I3L3R5 266 aa23.82■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 ABCA8O94911 1581 aa23.82■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.82■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.81■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.79■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.78■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.77■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.77■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.77■■□□□ 1.4
TTC13-202ENST00000366662 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 CHD1O14646 1710 aa23.75■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.74■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.73■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 KIF15Q9NS87 1388 aa23.73■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 CCDC7Q96M83 1385 aa23.72■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 RGL3Q3MIN7 710 aa23.72■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.72■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TTC13-202ENST00000366662 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.7■■□□□ 1.38
TTC13-202ENST00000366662 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.69■■□□□ 1.38
TTC13-202ENST00000366662 ADGRL2O95490 1459 aa23.66■■□□□ 1.38
TTC13-202ENST00000366662 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
TTC13-202ENST00000366662 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.65■■□□□ 1.38
TTC13-202ENST00000366662 MRS2Q9HD23 443 aa23.64■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 MBD5Q9P267 1494 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 USP47Q96K76 1375 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC13-202ENST00000366662 NEFLP07196 543 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC13-202ENST00000366662 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.362e-7■■■■□ 26.2
TTC13-202ENST00000366662 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 AFAP1Q8N556 730 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC13-202ENST00000366662 PREX2Q70Z35 1606 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 ABCC2Q92887 1545 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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