RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 UACAQ9BZF9 1416 aa25.9■■□□□ 1.74
PDE4D-204ENST00000358923 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-204ENST00000358923 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PDE4D-204ENST00000358923 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC5O15440 1437 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-204ENST00000358923 MIA2Q96PC5 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
PDE4D-204ENST00000358923 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PDE4D-204ENST00000358923 DAPK1P53355 1430 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4D-204ENST00000358923 SHROOM2Q13796 1616 aa25.84■■□□□ 1.73
PDE4D-204ENST00000358923 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4D-204ENST00000358923 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.81■■□□□ 1.72
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-204ENST00000358923 OSCARQ8IYS5 282 aa25.75■■□□□ 1.71
PDE4D-204ENST00000358923 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4D-204ENST00000358923 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.7■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC2Q92887 1545 aa25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 MIER1Q8N108 512 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 AKNAQ7Z591 1439 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 NCOA1Q15788 1441 aa25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-204ENST00000358923 TSPY4P0CV99 314 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 TSPY10P0CW01 314 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 TONSLQ96HA7 1378 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 ROCK1Q13464 1354 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.56■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.53■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 MBD5Q9P267 1494 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4D-204ENST00000358923 PKD2Q13563 968 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 AFAP1Q8N556 730 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.5■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 KIF15Q9NS87 1388 aa25.49■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 NUP155O75694 1391 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.47■■□□□ 1.67
PDE4D-204ENST00000358923 PREX2Q70Z35 1606 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.43■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 PZPP20742 1482 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.42■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.41■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.39■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.39■■□□□ 1.66
PDE4D-204ENST00000358923 ASXL2Q76L83 1435 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRL2O95490 1459 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 PLCH2O75038 1416 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.3■■□□□ 1.64
PDE4D-204ENST00000358923 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.29■■□□□ 1.64
PDE4D-204ENST00000358923 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.28■■□□□ 1.64
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4D-204ENST00000358923 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 RGL3Q3MIN7 710 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 FANCAO15360 1455 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-204ENST00000358923 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC1P33527 1531 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-204ENST00000358923 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-204ENST00000358923 RAPGEF3O95398 923 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-204ENST00000358923 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-204ENST00000358923 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRL1O94910 1474 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 KIF3BO15066 747 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 CD109Q6YHK3 1445 aa25.11■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.09■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-204ENST00000358923 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms