RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.79■■■■■ 4.28
CRIP1-201ENST00000330233 PREX2Q70Z35 1606 aa41.77■■■■■ 4.28
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.75■■■■■ 4.27
CRIP1-201ENST00000330233 AKNAQ7Z591 1439 aa41.75■■■■■ 4.27
CRIP1-201ENST00000330233 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
CRIP1-201ENST00000330233 NCOA2Q15596 1464 aa41.74■■■■■ 4.27
CRIP1-201ENST00000330233 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
CRIP1-201ENST00000330233 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
CRIP1-201ENST00000330233 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.66■■■■■ 4.26
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRL1O94910 1474 aa41.61■■■■■ 4.25
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CRIP1-201ENST00000330233 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
CRIP1-201ENST00000330233 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.57■■■■■ 4.24
CRIP1-201ENST00000330233 RAPGEF3O95398 923 aa41.53■■■■■ 4.24
CRIP1-201ENST00000330233 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.47■■■■■ 4.23
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.47■■■■■ 4.23
CRIP1-201ENST00000330233 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.47■■■■■ 4.23
CRIP1-201ENST00000330233 RICTORQ6R327 1708 aa41.47■■■■■ 4.23
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC1P33527 1531 aa41.45■■■■■ 4.23
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.43■■■■■ 4.22
CRIP1-201ENST00000330233 MIA2Q96PC5 1412 aa41.42■■■■■ 4.22
CRIP1-201ENST00000330233 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.41■■■■■ 4.22
CRIP1-201ENST00000330233 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.4■■■■■ 4.22
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.38■■■■■ 4.22
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.38■■■■■ 4.21
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
CRIP1-201ENST00000330233 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CRIP1-201ENST00000330233 AFAP1Q8N556 730 aa41.35■■■■■ 4.21
CRIP1-201ENST00000330233 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.34■■■■■ 4.21
CRIP1-201ENST00000330233 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.31■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.31■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.31■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.3■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.29■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 KDM5CP41229 1560 aa41.26■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.26■■■■■ 4.2
CRIP1-201ENST00000330233 MBD5Q9P267 1494 aa41.24■■■■■ 4.19
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.22■■■■■ 4.19
CRIP1-201ENST00000330233 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.21■■■■■ 4.19
CRIP1-201ENST00000330233 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.18■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.17■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.16■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.15■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.13■■■■■ 4.18
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.11■■■■■ 4.17
CRIP1-201ENST00000330233 TSPY4P0CV99 314 aa41.11■■■■■ 4.17
CRIP1-201ENST00000330233 TSPY10P0CW01 314 aa41.11■■■■■ 4.17
CRIP1-201ENST00000330233 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.09■■■■■ 4.17
CRIP1-201ENST00000330233 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.08■■■■■ 4.17
CRIP1-201ENST00000330233 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
CRIP1-201ENST00000330233 ATP10AO60312 1499 aa41.05■■■■■ 4.16
CRIP1-201ENST00000330233 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.04■■■■■ 4.16
CRIP1-201ENST00000330233 ATP7AQ04656 1500 aa41.02■■■■■ 4.16
CRIP1-201ENST00000330233 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
CRIP1-201ENST00000330233 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.97■■■■■ 4.15
CRIP1-201ENST00000330233 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
CRIP1-201ENST00000330233 ABCA6Q8N139 1617 aa40.96■■■■■ 4.15
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.96■■■■■ 4.15
CRIP1-201ENST00000330233 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC5O15440 1437 aa40.94■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 DAPK1P53355 1430 aa40.93■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.92■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.9■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 REREQ9P2R6 1566 aa40.89■■■■■ 4.14
CRIP1-201ENST00000330233 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.87■■■■■ 4.13
CRIP1-201ENST00000330233 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.87■■■■■ 4.13
CRIP1-201ENST00000330233 A2MP01023 1474 aa40.81■■■■■ 4.12
CRIP1-201ENST00000330233 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.79■■■■■ 4.12
CRIP1-201ENST00000330233 AGLP35573 1532 aa40.76■■■■■ 4.12
CRIP1-201ENST00000330233 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.76■■■■■ 4.12
CRIP1-201ENST00000330233 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CRIP1-201ENST00000330233 PLXNC1O60486 1568 aa40.76■■■■■ 4.11
CRIP1-201ENST00000330233 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.73■■■■■ 4.11
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.73■■■■■ 4.11
CRIP1-201ENST00000330233 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.69■■■■■ 4.11
CRIP1-201ENST00000330233 ITGAEP38570 1179 aa40.68■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.67■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 NCOA1Q15788 1441 aa40.66■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRL2O95490 1459 aa40.66■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 MLECQ14165 292 aa40.66■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRKQ15262 1439 aa40.65■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 KIF15Q9NS87 1388 aa40.64■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.64■■■■■ 4.1
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.63■■■■■ 4.09
CRIP1-201ENST00000330233 ROCK1Q13464 1354 aa40.59■■■■■ 4.09
CRIP1-201ENST00000330233 KIF3BO15066 747 aa40.57■■■■■ 4.08
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CRIP1-201ENST00000330233 GGT6Q6P531 493 aa40.52■■■■■ 4.08
CRIP1-201ENST00000330233 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.52■■■■■ 4.08
CRIP1-201ENST00000330233 ERBINQ96RT1 1412 aa40.52■■■■■ 4.08
CRIP1-201ENST00000330233 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.5■■■■■ 4.07
CRIP1-201ENST00000330233 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
CRIP1-201ENST00000330233 MADDQ8WXG6 1647 aa40.49■■■■■ 4.07
CRIP1-201ENST00000330233 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.41■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms