RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP4R4-202ENST00000328839 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.14■■■■■ 4.18
PPP4R4-202ENST00000328839 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.11■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.1■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.1■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.07■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
PPP4R4-202ENST00000328839 CLIP1P30622 1438 aa41.06■■■■■ 4.16
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.02■■■■■ 4.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 MLECQ14165 292 aa40.98■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.96■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.93■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.91■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP10AO60312 1499 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.89■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.85■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 PREX2Q70Z35 1606 aa40.83■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 KDM5CP41229 1560 aa40.82■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 AFAP1Q8N556 730 aa40.82■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPA2P54652 639 aa40.74■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.73■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC1P33527 1531 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCA6Q8N139 1617 aa40.68■■■■■ 4.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.65■■■■■ 4.1
PPP4R4-202ENST00000328839 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.63■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO41Q8TF61 875 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 REREQ9P2R6 1566 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.59■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP4R4-202ENST00000328839 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
PPP4R4-202ENST00000328839 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 AGLP35573 1532 aa40.47■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 C3P01024 1663 aa40.43■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.41■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.39■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.39■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.32■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP7AQ04656 1500 aa40.3■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 STRCQ7RTU9 1775 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP162Q5TB80 1403 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 TIAM1Q13009 1591 aa40.24■■■■■ 4.03
PPP4R4-202ENST00000328839 CERKQ8TCT0 537 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP4R4-202ENST00000328839 MROH2AA6NES4 1674 aa40.19■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.18■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 A2MP01023 1474 aa40.16■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 PLXNC1O60486 1568 aa40.15■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.12■■■■■ 4.01
PPP4R4-202ENST00000328839 ZMYM3Q14202 1370 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP4R4-202ENST00000328839 GGT6Q6P531 493 aa40.05■■■■■ 4
PPP4R4-202ENST00000328839 NPATQ14207 1427 aa40.05■■■■■ 4
PPP4R4-202ENST00000328839 MBD5Q9P267 1494 aa40.03■■■■■ 4
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA2Q15596 1464 aa40■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRTO14522 1441 aa39.99■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA1Q15788 1441 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.95■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.91■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRKQ15262 1439 aa39.88■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF3BO15066 747 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.76■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 PLA2R1Q13018 1463 aa39.72■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 TSPY4P0CV99 314 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 TSPY10P0CW01 314 aa39.7■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms