RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326715.4

VWDE-202, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 5

Gene VWDE, Length 1,394 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-202ENST00000326715 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.12■■□□□ 1.29
VWDE-202ENST00000326715 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.12■■□□□ 1.29
VWDE-202ENST00000326715 PREX2Q70Z35 1606 aa23.1■■□□□ 1.29
VWDE-202ENST00000326715 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.1■■□□□ 1.29
VWDE-202ENST00000326715 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.09■■□□□ 1.29
VWDE-202ENST00000326715 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.08■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.07■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.06■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.05■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 AFAP1Q8N556 730 aa23.04■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.03■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.03■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 TIAM1Q13009 1591 aa23.02■■□□□ 1.28
VWDE-202ENST00000326715 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.01■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.01■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 ABCC1P33527 1531 aa23■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.98■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.97■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.97■■□□□ 1.27
VWDE-202ENST00000326715 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.263e-7■■■■□ 21.9
VWDE-202ENST00000326715 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 NCOA2Q15596 1464 aa22.94■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 KDM5CP41229 1560 aa22.94■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.93■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.92■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.92■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.91■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.9■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.9■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
VWDE-202ENST00000326715 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.89■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 ABCA6Q8N139 1617 aa22.88■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.88■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 MLECQ14165 292 aa22.88■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 MADDQ8WXG6 1647 aa22.87■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.86■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 ATP10AO60312 1499 aa22.86■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.86■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.84■■□□□ 1.25
VWDE-202ENST00000326715 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.82■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 MAP3K1Q13233 1512 aa22.82■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 MBD5Q9P267 1494 aa22.8■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.8■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.79■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 PTPRMP28827 1452 aa22.79■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.78■■□□□ 1.24
VWDE-202ENST00000326715 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.76■■□□□ 1.23
VWDE-202ENST00000326715 ATP7AQ04656 1500 aa22.74■■□□□ 1.23
VWDE-202ENST00000326715 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
VWDE-202ENST00000326715 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.71■■□□□ 1.23
VWDE-202ENST00000326715 APLP2Q06481 763 aa22.71■■□□□ 1.23
VWDE-202ENST00000326715 REREQ9P2R6 1566 aa22.7■■□□□ 1.22
VWDE-202ENST00000326715 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.69■■□□□ 1.22
VWDE-202ENST00000326715 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VWDE-202ENST00000326715 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VWDE-202ENST00000326715 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
VWDE-202ENST00000326715 AGLP35573 1532 aa22.65■■□□□ 1.22
VWDE-202ENST00000326715 A2MP01023 1474 aa22.63■■□□□ 1.21
VWDE-202ENST00000326715 PLXNC1O60486 1568 aa22.62■■□□□ 1.21
VWDE-202ENST00000326715 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.62■■□□□ 1.21
VWDE-202ENST00000326715 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.61■■□□□ 1.21
VWDE-202ENST00000326715 MIA2Q96PC5 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
VWDE-202ENST00000326715 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.59■■□□□ 1.21
VWDE-202ENST00000326715 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.58■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.57■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 GGT6Q6P531 493 aa22.54■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 ABCC5O15440 1437 aa22.53■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.53■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 C3P01024 1663 aa22.53■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 HSPA2P54652 639 aa22.52■■□□□ 1.2
VWDE-202ENST00000326715 TSPY4P0CV99 314 aa22.51■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 TSPY10P0CW01 314 aa22.51■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.51■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.5■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 KIF3BO15066 747 aa22.49■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.48■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.47■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 DAPK1P53355 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
VWDE-202ENST00000326715 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 ZMYM3Q14202 1370 aa22.43■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.43■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.4■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 MROH2AA6NES4 1674 aa22.4■■□□□ 1.18
VWDE-202ENST00000326715 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.39■■□□□ 1.17
VWDE-202ENST00000326715 PTPRKQ15262 1439 aa22.38■■□□□ 1.17
VWDE-202ENST00000326715 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.38■■□□□ 1.17
VWDE-202ENST00000326715 KIF15Q9NS87 1388 aa22.38■■□□□ 1.17
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