RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326715.4

VWDE-202, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 5

Gene VWDE, Length 1,394 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-202ENST00000326715 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.51■■■■□ 3.27
VWDE-202ENST00000326715 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.52■■■□□ 2.64
VWDE-202ENST00000326715 ABCC9O60706 1549 aa31.2■■■□□ 2.59
VWDE-202ENST00000326715 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.84■■■□□ 2.37
VWDE-202ENST00000326715 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.76■■■□□ 2.35
VWDE-202ENST00000326715 NACADO15069 1562 aa29.67■■■□□ 2.34
VWDE-202ENST00000326715 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
VWDE-202ENST00000326715 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.37■■■□□ 2.29
VWDE-202ENST00000326715 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.26■■■□□ 2.27
VWDE-202ENST00000326715 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.24■■■□□ 2.27
VWDE-202ENST00000326715 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
VWDE-202ENST00000326715 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.04■■■□□ 2.24
VWDE-202ENST00000326715 SCRIBQ14160 1630 aa28.94■■■□□ 2.22
VWDE-202ENST00000326715 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.91■■■□□ 2.22
VWDE-202ENST00000326715 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.39■■■□□ 2.14
VWDE-202ENST00000326715 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
VWDE-202ENST00000326715 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.16■■■□□ 2.1
VWDE-202ENST00000326715 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.97■■■□□ 2.07
VWDE-202ENST00000326715 SMARCA4P51532 1647 aa27.6■■■□□ 2.01
VWDE-202ENST00000326715 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.48■■□□□ 1.99
VWDE-202ENST00000326715 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.46■■□□□ 1.99
VWDE-202ENST00000326715 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
VWDE-202ENST00000326715 NCAPD3P42695 1498 aa27.43■■□□□ 1.98
VWDE-202ENST00000326715 SMARCA2P51531 1590 aa27.33■■□□□ 1.97
VWDE-202ENST00000326715 HMGXB3Q12766 1538 aa27.24■■□□□ 1.95
VWDE-202ENST00000326715 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.24■■□□□ 1.95
VWDE-202ENST00000326715 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
VWDE-202ENST00000326715 WIZO95785 1651 aa27.17■■□□□ 1.94
VWDE-202ENST00000326715 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
VWDE-202ENST00000326715 NESP48681 1621 aa27.01■■□□□ 1.92
VWDE-202ENST00000326715 ERCC6Q03468 1493 aa26.78■■□□□ 1.88
VWDE-202ENST00000326715 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
VWDE-202ENST00000326715 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.69■■□□□ 1.86
VWDE-202ENST00000326715 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.65■■□□□ 1.86
VWDE-202ENST00000326715 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.62■■□□□ 1.85
VWDE-202ENST00000326715 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
VWDE-202ENST00000326715 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.52■■□□□ 1.84
VWDE-202ENST00000326715 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.51■■□□□ 1.83
VWDE-202ENST00000326715 CUX2O14529 1486 aa26.47■■□□□ 1.83
VWDE-202ENST00000326715 CFTRP13569 1480 aa26.45■■□□□ 1.82
VWDE-202ENST00000326715 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.36■■□□□ 1.81
VWDE-202ENST00000326715 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
VWDE-202ENST00000326715 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.31■■□□□ 1.8
VWDE-202ENST00000326715 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.31■■□□□ 1.8
VWDE-202ENST00000326715 WDR62O43379 1518 aa26.23■■□□□ 1.79
VWDE-202ENST00000326715 PRDM2Q13029 1718 aa26.21■■□□□ 1.79
VWDE-202ENST00000326715 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
VWDE-202ENST00000326715 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.95■■□□□ 1.75
VWDE-202ENST00000326715 TOPBP1Q92547 1522 aa25.95■■□□□ 1.74
VWDE-202ENST00000326715 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.85■■□□□ 1.73
VWDE-202ENST00000326715 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
VWDE-202ENST00000326715 ABCC8Q09428 1581 aa25.75■■□□□ 1.71
VWDE-202ENST00000326715 CUX1P39880 1505 aa25.75■■□□□ 1.71
VWDE-202ENST00000326715 IFT140Q96RY7 1462 aa25.74■■□□□ 1.71
VWDE-202ENST00000326715 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
VWDE-202ENST00000326715 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.71■■□□□ 1.71
VWDE-202ENST00000326715 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
VWDE-202ENST00000326715 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.65■■□□□ 1.7
VWDE-202ENST00000326715 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 19.6
VWDE-202ENST00000326715 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
VWDE-202ENST00000326715 SOGA1O94964 1423 aa25.6■■□□□ 1.69
VWDE-202ENST00000326715 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
VWDE-202ENST00000326715 SYNJ1O43426 1573 aa25.49■■□□□ 1.67
VWDE-202ENST00000326715 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
VWDE-202ENST00000326715 WDR97A6NE52 1622 aa25.43■■□□□ 1.66
VWDE-202ENST00000326715 OSCARQ8IYS5 282 aa25.41■■□□□ 1.66
VWDE-202ENST00000326715 TOP2BQ02880 1626 aa25.4■■□□□ 1.66
VWDE-202ENST00000326715 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.4■■□□□ 1.66
VWDE-202ENST00000326715 CHD1O14646 1710 aa25.35■■□□□ 1.65
VWDE-202ENST00000326715 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.34■■□□□ 1.65
VWDE-202ENST00000326715 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.33■■□□□ 1.65
VWDE-202ENST00000326715 FBLN2P98095 1184 aa25.31■■□□□ 1.64
VWDE-202ENST00000326715 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.28■■□□□ 1.64
VWDE-202ENST00000326715 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.28■■□□□ 1.64
VWDE-202ENST00000326715 GRIN2BQ13224 1484 aa25.26■■□□□ 1.63
VWDE-202ENST00000326715 PBRM1Q86U86 1689 aa25.26■■□□□ 1.63
VWDE-202ENST00000326715 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
VWDE-202ENST00000326715 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
VWDE-202ENST00000326715 TRIM41Q8WV44 630 aa25.15■■□□□ 1.62
VWDE-202ENST00000326715 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.12■■□□□ 1.61
VWDE-202ENST00000326715 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.12■■□□□ 1.61
VWDE-202ENST00000326715 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.12■■□□□ 1.61
VWDE-202ENST00000326715 SYNJ2O15056 1496 aa25.11■■□□□ 1.61
VWDE-202ENST00000326715 ARHGEF11O15085 1522 aa25.06■■□□□ 1.6
VWDE-202ENST00000326715 ADAMTS12P58397 1594 aa25.05■■□□□ 1.6
VWDE-202ENST00000326715 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.03■■□□□ 1.6
VWDE-202ENST00000326715 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.98■■□□□ 1.59
VWDE-202ENST00000326715 GRIN2AQ12879 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
VWDE-202ENST00000326715 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.95■■□□□ 1.58
VWDE-202ENST00000326715 CEP170Q5SW79 1584 aa24.93■■□□□ 1.58
VWDE-202ENST00000326715 ARAP1Q96P48 1450 aa24.9■■□□□ 1.58
VWDE-202ENST00000326715 IGF1RP08069 1367 aa24.89■■□□□ 1.58
VWDE-202ENST00000326715 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.89■■□□□ 1.57
VWDE-202ENST00000326715 KIF27Q86VH2 1401 aa24.87■■□□□ 1.57
VWDE-202ENST00000326715 NUP160Q12769 1436 aa24.87■■□□□ 1.57
VWDE-202ENST00000326715 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.86■■□□□ 1.57
VWDE-202ENST00000326715 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.83■■□□□ 1.57
VWDE-202ENST00000326715 CUL7Q14999 1698 aa24.71■■□□□ 1.55
VWDE-202ENST00000326715 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.7■■□□□ 1.55
VWDE-202ENST00000326715 SHROOM2Q13796 1616 aa24.69■■□□□ 1.54
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