RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.5■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.49■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 PREX2Q70Z35 1606 aa40.48■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.45■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.45■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.38■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.37■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.35■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.33■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.32■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 TIAM1Q13009 1591 aa40.31■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.3■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.27■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.26■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC1P33527 1531 aa40.25■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.24■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 AFAP1Q8N556 730 aa40.23■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.23■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.22■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
CTXN1-201ENST00000318978 KDM5CP41229 1560 aa40.16■■■■■ 4.02
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.16■■■■■ 4.02
CTXN1-201ENST00000318978 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.13■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.13■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.13■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 NCOA2Q15596 1464 aa40.12■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 APLP2Q06481 763 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 MAP3K1Q13233 1512 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 ATP10AO60312 1499 aa40.07■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.07■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.07■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.05■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.03■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.03■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.02■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.97■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 ABCA6Q8N139 1617 aa39.97■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 MADDQ8WXG6 1647 aa39.96■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 MLECQ14165 292 aa39.96■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.95■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
CTXN1-201ENST00000318978 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
CTXN1-201ENST00000318978 PTPRMP28827 1452 aa39.87■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.87■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 ATP7AQ04656 1500 aa39.84■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 REREQ9P2R6 1566 aa39.84■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.82■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 MBD5Q9P267 1494 aa39.81■■■■□ 3.96
CTXN1-201ENST00000318978 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CTXN1-201ENST00000318978 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.76■■■■□ 3.96
CTXN1-201ENST00000318978 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.75■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.74■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 AGLP35573 1532 aa39.71■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.71■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 MIA2Q96PC5 1412 aa39.69■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.67■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.67■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 A2MP01023 1474 aa39.65■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.65■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 TSPY4P0CV99 314 aa39.62■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 TSPY10P0CW01 314 aa39.62■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 PLXNC1O60486 1568 aa39.58■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.57■■■■□ 3.92
CTXN1-201ENST00000318978 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.5■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 GGT6Q6P531 493 aa39.46■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.45■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 C3P01024 1663 aa39.42■■■■□ 3.9
CTXN1-201ENST00000318978 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.42■■■■□ 3.9
CTXN1-201ENST00000318978 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CTXN1-201ENST00000318978 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.38■■■■□ 3.9
CTXN1-201ENST00000318978 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 KIF3BO15066 747 aa39.37■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.36■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 MROH2AA6NES4 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC5O15440 1437 aa39.34■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.32■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 DAPK1P53355 1430 aa39.31■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.3■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.28■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 ZMYM3Q14202 1370 aa39.27■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 HSPA2P54652 639 aa39.22■■■■□ 3.87
CTXN1-201ENST00000318978 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.22■■■■□ 3.87
CTXN1-201ENST00000318978 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms