RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 RICTORQ6R327 1708 aa27.24■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.24■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 CEP162Q5TB80 1403 aa27.22■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.21■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SFTPC-201ENST00000318561 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.19■■□□□ 1.94
SFTPC-201ENST00000318561 STRCQ7RTU9 1775 aa27.19■■□□□ 1.94
SFTPC-201ENST00000318561 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.18■■□□□ 1.94
SFTPC-201ENST00000318561 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.17■■□□□ 1.94
SFTPC-201ENST00000318561 HECW1Q76N89 1606 aa27.15■■□□□ 1.94
SFTPC-201ENST00000318561 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.13■■□□□ 1.93
SFTPC-201ENST00000318561 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.13■■□□□ 1.93
SFTPC-201ENST00000318561 PTPRTO14522 1441 aa27.11■■□□□ 1.93
SFTPC-201ENST00000318561 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.1■■□□□ 1.93
SFTPC-201ENST00000318561 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SFTPC-201ENST00000318561 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.09■■□□□ 1.93
SFTPC-201ENST00000318561 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.07■■□□□ 1.92
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SFTPC-201ENST00000318561 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.05■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.05■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.03■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.03■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 ATP10AO60312 1499 aa27.02■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.02■■□□□ 1.92
SFTPC-201ENST00000318561 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27■■□□□ 1.91
SFTPC-201ENST00000318561 SCAPERQ9BY12 1400 aa27■■□□□ 1.91
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.97■■□□□ 1.91
SFTPC-201ENST00000318561 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.93■■□□□ 1.9
SFTPC-201ENST00000318561 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SFTPC-201ENST00000318561 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.89■■□□□ 1.89
SFTPC-201ENST00000318561 NCOA1Q15788 1441 aa26.88■■□□□ 1.89
SFTPC-201ENST00000318561 PLCH2O75038 1416 aa26.86■■□□□ 1.89
SFTPC-201ENST00000318561 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SFTPC-201ENST00000318561 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SFTPC-201ENST00000318561 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.81■■□□□ 1.88
SFTPC-201ENST00000318561 KIF14Q15058 1648 aa26.79■■□□□ 1.88
SFTPC-201ENST00000318561 C3P01024 1663 aa26.78■■□□□ 1.88
SFTPC-201ENST00000318561 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.77■■□□□ 1.88
SFTPC-201ENST00000318561 AFAP1Q8N556 730 aa26.77■■□□□ 1.88
SFTPC-201ENST00000318561 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.75■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.74■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 HSPA1LP34931 641 aa26.73■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.72■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.72■■□□□ 1.87
SFTPC-201ENST00000318561 TIAM1Q13009 1591 aa26.7■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.7■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.7■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.68■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 KDM5CP41229 1560 aa26.67■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.66■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 REREQ9P2R6 1566 aa26.65■■□□□ 1.86
SFTPC-201ENST00000318561 MAP3K1Q13233 1512 aa26.64■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 PIP4K2BP78356 416 aa26.63■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 AGLP35573 1532 aa26.61■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 ABCA6Q8N139 1617 aa26.61■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.6■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 APLP2Q06481 763 aa26.59■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 NPATQ14207 1427 aa26.58■■□□□ 1.85
SFTPC-201ENST00000318561 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.57■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.57■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 PKD2Q13563 968 aa26.57■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 PREX2Q70Z35 1606 aa26.57■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.56■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.56■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.55■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 PLA2R1Q13018 1463 aa26.52■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 ZMYM3Q14202 1370 aa26.52■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.52■■□□□ 1.84
SFTPC-201ENST00000318561 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.51■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 TOM1O60784 492 aa26.5■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 NCOA2Q15596 1464 aa26.48■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.47■■□□□ 1.83
SFTPC-201ENST00000318561 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SFTPC-201ENST00000318561 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SFTPC-201ENST00000318561 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.4■■□□□ 1.82
SFTPC-201ENST00000318561 MROH2AA6NES4 1674 aa26.4■■□□□ 1.82
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 ABCC1P33527 1531 aa26.38■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 PTPRKQ15262 1439 aa26.38■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.37■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.36■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 CPS1P31327 1500 aa26.35■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.33■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.33■■□□□ 1.81
SFTPC-201ENST00000318561 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SFTPC-201ENST00000318561 ALKQ9UM73 1620 aa26.3■■□□□ 1.8
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