RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.16■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.14■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.14■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.13■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.12■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 PREX2Q70Z35 1606 aa15.11■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.11■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 PLCH2O75038 1416 aa15.11■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.1■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.09■□□□□ 0.01
GINS3-201ENST00000318129 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.08■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.08■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.07■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 ITGAEP38570 1179 aa15.07■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.06■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 GLI2P10070 1586 aa15.05■□□□□ 0
GINS3-201ENST00000318129 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.05■□□□□ -0
GINS3-201ENST00000318129 CD109Q6YHK3 1445 aa15.04■□□□□ -0
GINS3-201ENST00000318129 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
GINS3-201ENST00000318129 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.03■□□□□ -0
GINS3-201ENST00000318129 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.02■□□□□ -0
GINS3-201ENST00000318129 DAPK1P53355 1430 aa15.02□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 ABCC5O15440 1437 aa15.01□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.01□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 FAM69CQ0P6D2 419 aa15□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 DIP2BQ9P265 1576 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 FANCAO15360 1455 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 PTPRKQ15262 1439 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 MBD5Q9P267 1494 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 TSPY4P0CV99 314 aa14.97□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 TSPY10P0CW01 314 aa14.97□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 ROCK1Q13464 1354 aa14.97□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 AKNAQ7Z591 1439 aa14.97□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.97□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.96□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.96□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 ABCC1P33527 1531 aa14.96□□□□□ -0.01
GINS3-201ENST00000318129 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.96□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 NEO1Q92859 1461 aa14.95□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.95□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.95□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 HFM1A2PYH4 1435 aa14.95□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 ADGRL1O94910 1474 aa14.93□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.93□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 ADGRL2O95490 1459 aa14.93□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.93□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.92□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.92□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.92□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 NAIPQ13075 1403 aa14.91□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.91□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.91□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.91□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.91□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.9□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 NCOA1Q15788 1441 aa14.9□□□□□ -0.02
GINS3-201ENST00000318129 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.89□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.89□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 AFAP1Q8N556 730 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 TSPOAP1O95153 1857 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.84□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 KIF15Q9NS87 1388 aa14.84□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 PLXNC1O60486 1568 aa14.84□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
GINS3-201ENST00000318129 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.81□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 KDM5CP41229 1560 aa14.81□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 ATP7AQ04656 1500 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 RICTORQ6R327 1708 aa14.78□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 RAPGEF3O95398 923 aa14.77□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.77□□□□□ -0.04
GINS3-201ENST00000318129 TRIM52Q96A61 297 aa14.77□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 BCL11AQ9H165 835 aa14.77□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.77□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 KDM6BO15054 1643 aa14.77□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 ERBINQ96RT1 1412 aa14.76□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.76□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.74□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.74□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.73□□□□□ -0.05
GINS3-201ENST00000318129 A2MP01023 1474 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms