RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309027.4

GOLIM4-201, Transcript of golgi integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GOLIM4, Length 2,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4-201ENST00000309027 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.31■■□□□ 1.48
GOLIM4-201ENST00000309027 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GOLIM4-201ENST00000309027 PREX2Q70Z35 1606 aa24.29■■□□□ 1.48
GOLIM4-201ENST00000309027 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.29■■□□□ 1.48
GOLIM4-201ENST00000309027 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GOLIM4-201ENST00000309027 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.26■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.25■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 KDM6BO15054 1643 aa24.25■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 ADGRL1O94910 1474 aa24.23■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.22■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.21■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GOLIM4-201ENST00000309027 MIA2Q96PC5 1412 aa24.2■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 RAPGEF3O95398 923 aa24.19■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.18■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.18■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.15■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCC1P33527 1531 aa24.15■■□□□ 1.46
GOLIM4-201ENST00000309027 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.14■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.13■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.456e-7■■■■□ 23.7
GOLIM4-201ENST00000309027 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 AFAP1Q8N556 730 aa24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 MBD5Q9P267 1494 aa24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4-201ENST00000309027 RICTORQ6R327 1708 aa24.06■■□□□ 1.44
GOLIM4-201ENST00000309027 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GOLIM4-201ENST00000309027 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.04■■□□□ 1.44
GOLIM4-201ENST00000309027 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.04■■□□□ 1.44
GOLIM4-201ENST00000309027 KDM5CP41229 1560 aa24.03■■□□□ 1.44
GOLIM4-201ENST00000309027 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.02■■□□□ 1.44
GOLIM4-201ENST00000309027 MLH3Q9UHC1 1453 aa24■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.99■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.99■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 TSPY4P0CV99 314 aa23.97■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 TSPY10P0CW01 314 aa23.97■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.96■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
GOLIM4-201ENST00000309027 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.94■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.94■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.94■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.93■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCC5O15440 1437 aa23.92■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.91■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 DAPK1P53355 1430 aa23.9■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 ATP10AO60312 1499 aa23.9■■□□□ 1.42
GOLIM4-201ENST00000309027 ATP7AQ04656 1500 aa23.89■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.87■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.86■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.86■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.85■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.84■■□□□ 1.41
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCA6Q8N139 1617 aa23.82■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 REREQ9P2R6 1566 aa23.8■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.79■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 A2MP01023 1474 aa23.79■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 PTPRKQ15262 1439 aa23.78■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.78■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.77■■□□□ 1.4
GOLIM4-201ENST00000309027 ITGAEP38570 1179 aa23.76■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 ADGRL2O95490 1459 aa23.75■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 NCOA1Q15788 1441 aa23.75■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 AGLP35573 1532 aa23.74■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.74■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 PLXNC1O60486 1568 aa23.74■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 ROCK1Q13464 1354 aa23.73■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 KIF15Q9NS87 1388 aa23.72■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.72■■□□□ 1.39
GOLIM4-201ENST00000309027 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.69■■□□□ 1.38
GOLIM4-201ENST00000309027 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.68■■□□□ 1.38
GOLIM4-201ENST00000309027 MLECQ14165 292 aa23.65■■□□□ 1.38
GOLIM4-201ENST00000309027 ERBINQ96RT1 1412 aa23.65■■□□□ 1.38
GOLIM4-201ENST00000309027 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.65■■□□□ 1.38
GOLIM4-201ENST00000309027 KIF3BO15066 747 aa23.65■■□□□ 1.38
GOLIM4-201ENST00000309027 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.62■■□□□ 1.37
GOLIM4-201ENST00000309027 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.62■■□□□ 1.37
GOLIM4-201ENST00000309027 GGT6Q6P531 493 aa23.6■■□□□ 1.37
GOLIM4-201ENST00000309027 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.59■■□□□ 1.37
GOLIM4-201ENST00000309027 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
GOLIM4-201ENST00000309027 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.57■■□□□ 1.36
GOLIM4-201ENST00000309027 HFM1A2PYH4 1435 aa23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4-201ENST00000309027 NAIPQ13075 1403 aa23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4-201ENST00000309027 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4-201ENST00000309027 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms