RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 CDCA8Q53HL2 280 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40-201ENST00000285243 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD40-201ENST00000285243 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 TMF1P82094 1093 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 PRXQ9BXM0 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 ARXQ96QS3 562 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
ANKRD40-201ENST00000285243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 CFAP53Q96M91 514 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 RGS3P49796 1198 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 PTPRGP23470 1445 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD40-201ENST00000285243 KANK1Q14678 1352 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD40-201ENST00000285243 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ANKRD40-201ENST00000285243 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ANKRD40-201ENST00000285243 CFTRP13569 1480 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD40-201ENST00000285243 NUTM2FA1L443 756 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 TOP2BQ02880 1626 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 MORC1Q86VD1 984 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
ANKRD40-201ENST00000285243 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40-201ENST00000285243 NUDCQ9Y266 331 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40-201ENST00000285243 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40-201ENST00000285243 UACAQ9BZF9 1416 aa24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40-201ENST00000285243 CUX1P39880 1505 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.89■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 AFAP1Q8N556 730 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR97A6NE52 1622 aa24.83■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 RALBP1Q15311 655 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 PANK3Q9H999 370 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 OSCARQ8IYS5 282 aa24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 TIAM1Q13009 1591 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC7Q96M83 1385 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 TOPBP1Q92547 1522 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40-201ENST00000285243 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 NCOA2Q15596 1464 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 NLRP13Q86W25 1043 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 USP47Q96K76 1375 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 KIF15Q9NS87 1388 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 BECN1Q14457 450 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40-201ENST00000285243 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.7■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 APBB1O00213 710 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 PLIN1O60240 522 aa24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 PRDM2Q13029 1718 aa24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 GRIN2BQ13224 1484 aa24.67■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 HFM1A2PYH4 1435 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC184Q52MB2 194 aa24.64■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.64■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 PDE3BQ13370 1112 aa24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.62■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD40-201ENST00000285243 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms