RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282096.8

PDE3B-201, Transcript of phosphodiesterase 3B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE3B, Length 6,076 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3B-201ENST00000282096 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.51■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.49■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 SOGA1O94964 1423 aa22.46■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 NPHP1O15259 732 aa22.45■■□□□ 1.19
PDE3B-201ENST00000282096 MS4A1P11836 297 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 GGT6Q6P531 493 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 MCCP23508 829 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 NUDCQ9Y266 331 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 GBP4Q96PP9 640 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE3B-201ENST00000282096 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 CLSTN1O94985 981 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 PTMSP20962 102 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PDE3B-201ENST00000282096 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.33■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.3■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 APBB1O00213 710 aa22.29■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 OSCARQ8IYS5 282 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA2Q08379 1002 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 CFAP44Q96MT7 982 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.23■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.22■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.21■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
PDE3B-201ENST00000282096 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 EID1Q9Y6B2 187 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 TMF1P82094 1093 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.19■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 SOX12O15370 315 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 TPM4P67936 248 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.148e-7■■■■□ 20
PDE3B-201ENST00000282096 STK26Q9P289 416 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PDE3B-201ENST00000282096 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.14■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 PDE4CQ08493 712 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 JPH4Q96JJ6 628 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 KIF3BO15066 747 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 MORC1Q86VD1 984 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE3B-201ENST00000282096 RALBP1Q15311 655 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 FMN1Q68DA7 1419 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 USP35Q9P2H5 1018 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE3B-201ENST00000282096 GSE1Q14687 1217 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 SLC4A3P48751 1232 aa22■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 FOXD1Q16676 465 aa22■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 ABCC8Q09428 1581 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 PHF14O94880 888 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 PKD2Q13563 968 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.98■■□□□ 1.11
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