RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
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UBE2B-201ENST00000265339 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
UBE2B-201ENST00000265339 ITGAEP38570 1179 aa30.24■■■□□ 2.43
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UBE2B-201ENST00000265339 CD109Q6YHK3 1445 aa30■■■□□ 2.39
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UBE2B-201ENST00000265339 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.92■■■□□ 2.38
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UBE2B-201ENST00000265339 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.45■■■□□ 2.31
UBE2B-201ENST00000265339 ABCA6Q8N139 1617 aa29.45■■■□□ 2.3
UBE2B-201ENST00000265339 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
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UBE2B-201ENST00000265339 UNC13BO14795 1591 aa29.41■■■□□ 2.3
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