RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263062.8

EPC1-201, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPC1, Length 2,913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPC1-201ENST00000263062 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 DAPK1P53355 1430 aa16.19■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.18■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.17■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
EPC1-201ENST00000263062 KIF14Q15058 1648 aa16.13■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.12■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 ANP32CO43423 234 aa16.12■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.11■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 NUP160Q12769 1436 aa16.1■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.1■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.09■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.09■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.09■□□□□ 0.17
EPC1-201ENST00000263062 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 AKNAQ7Z591 1439 aa16.07■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 BCANQ96GW7 911 aa16.07■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.06■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 ATP10BO94823 1461 aa16.05■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 ROCK1Q13464 1354 aa16.05■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 NCOA1Q15788 1441 aa16.04■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 PKD2Q13563 968 aa16.02■□□□□ 0.16
EPC1-201ENST00000263062 CCDC184Q52MB2 194 aa16■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 PTPRGP23470 1445 aa16■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 BCL11AQ9H165 835 aa16■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 PZPP20742 1482 aa15.99■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.99■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 CCER2I3L3R5 266 aa15.97■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 ABCA8O94911 1581 aa15.97■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 FKBP8Q14318 412 aa15.96■□□□□ 0.15
EPC1-201ENST00000263062 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.95■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.95■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 NUP155O75694 1391 aa15.95■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.94■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.94■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 TSPY4P0CV99 314 aa15.94■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 TSPY10P0CW01 314 aa15.94■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.94■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.93■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.92■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.92■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.92■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.91■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.9■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 CCDC7Q96M83 1385 aa15.9■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 14.2
EPC1-201ENST00000263062 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.9■□□□□ 0.14
EPC1-201ENST00000263062 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.89■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 CHD1O14646 1710 aa15.88■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 KIF15Q9NS87 1388 aa15.88■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.88■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 ADGRL2O95490 1459 aa15.87■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.85■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.85■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.85■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 MBD5Q9P267 1494 aa15.84■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.84■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 RGL3Q3MIN7 710 aa15.84■□□□□ 0.13
EPC1-201ENST00000263062 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.83■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 MRS2Q9HD23 443 aa15.81■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 USP47Q96K76 1375 aa15.81■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.81■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.79■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.79■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.79■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.78■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.78■□□□□ 0.12
EPC1-201ENST00000263062 NEFLP07196 543 aa15.77■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.77■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.76■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.76■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 23.9
EPC1-201ENST00000263062 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.76■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.75■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.73■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.72■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.72■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 PREX2Q70Z35 1606 aa15.72■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 AFAP1Q8N556 730 aa15.71■□□□□ 0.11
EPC1-201ENST00000263062 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.7■□□□□ 0.1
EPC1-201ENST00000263062 ABCC2Q92887 1545 aa15.7■□□□□ 0.1
EPC1-201ENST00000263062 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.7■□□□□ 0.1
EPC1-201ENST00000263062 SHROOM2Q13796 1616 aa15.69■□□□□ 0.1
EPC1-201ENST00000263062 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
EPC1-201ENST00000263062 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
EPC1-201ENST00000263062 PLA2R1Q13018 1463 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms