RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 ANP32CO43423 234 aa27.18■■□□□ 1.94
LPCAT3-201ENST00000261407 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
LPCAT3-201ENST00000261407 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
LPCAT3-201ENST00000261407 SYNJ2O15056 1496 aa27.16■■□□□ 1.94
LPCAT3-201ENST00000261407 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.14■■□□□ 1.94
LPCAT3-201ENST00000261407 JPH4Q96JJ6 628 aa27.14■■□□□ 1.94
LPCAT3-201ENST00000261407 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
LPCAT3-201ENST00000261407 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
LPCAT3-201ENST00000261407 ROCK1Q13464 1354 aa27.11■■□□□ 1.93
LPCAT3-201ENST00000261407 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
LPCAT3-201ENST00000261407 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
LPCAT3-201ENST00000261407 CCER2I3L3R5 266 aa27.07■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.06■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF14Q15058 1648 aa27.06■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.05■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 NUP160Q12769 1436 aa27.04■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.03■■□□□ 1.92
LPCAT3-201ENST00000261407 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.01■■□□□ 1.91
LPCAT3-201ENST00000261407 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.01■■□□□ 1.91
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
LPCAT3-201ENST00000261407 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LPCAT3-201ENST00000261407 NCOA1Q15788 1441 aa26.96■■□□□ 1.91
LPCAT3-201ENST00000261407 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
LPCAT3-201ENST00000261407 BCANQ96GW7 911 aa26.92■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 PZPP20742 1482 aa26.92■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.91■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.91■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 ATP10BO94823 1461 aa26.9■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.89■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.89■■□□□ 1.9
LPCAT3-201ENST00000261407 FKBP8Q14318 412 aa26.88■■□□□ 1.89
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCA8O94911 1581 aa26.86■■□□□ 1.89
LPCAT3-201ENST00000261407 PKD2Q13563 968 aa26.82■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC184Q52MB2 194 aa26.82■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 ADGRL2O95490 1459 aa26.81■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.81■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.81■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.81■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.8■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.8■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC7Q96M83 1385 aa26.79■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.79■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.77■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
LPCAT3-201ENST00000261407 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.76■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.76■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 PTPRGP23470 1445 aa26.74■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.73■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.73■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 NUP155O75694 1391 aa26.71■■□□□ 1.87
LPCAT3-201ENST00000261407 TSPY4P0CV99 314 aa26.69■■□□□ 1.86
LPCAT3-201ENST00000261407 TSPY10P0CW01 314 aa26.69■■□□□ 1.86
LPCAT3-201ENST00000261407 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
LPCAT3-201ENST00000261407 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.69■■□□□ 1.86
LPCAT3-201ENST00000261407 MBD5Q9P267 1494 aa26.66■■□□□ 1.86
LPCAT3-201ENST00000261407 NEFLP07196 543 aa26.64■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.63■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF15Q9NS87 1388 aa26.62■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.61■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.6■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 CHD1O14646 1710 aa26.59■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 USP47Q96K76 1375 aa26.59■■□□□ 1.85
LPCAT3-201ENST00000261407 MRS2Q9HD23 443 aa26.58■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.58■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.57■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.56■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.55■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.55■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.51■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.5■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.49■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PREX2Q70Z35 1606 aa26.48■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.48■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.48■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.48■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 KDM5CP41229 1560 aa26.47■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.46■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.46■■□□□ 1.83
LPCAT3-201ENST00000261407 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.44■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 SHROOM2Q13796 1616 aa26.42■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.42■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.42■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.41■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.4■■□□□ 1.82
LPCAT3-201ENST00000261407 RGL3Q3MIN7 710 aa26.39■■□□□ 1.81
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.37■■□□□ 1.81
LPCAT3-201ENST00000261407 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.36■■□□□ 1.81
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCC2Q92887 1545 aa26.36■■□□□ 1.81
LPCAT3-201ENST00000261407 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms