RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.9■■□□□ 1.9
IMP4-201ENST00000259239 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
IMP4-201ENST00000259239 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.86■■□□□ 1.89
IMP4-201ENST00000259239 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
IMP4-201ENST00000259239 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
IMP4-201ENST00000259239 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
IMP4-201ENST00000259239 PTPRKQ15262 1439 aa26.81■■□□□ 1.88
IMP4-201ENST00000259239 PLCH2O75038 1416 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-201ENST00000259239 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.79■■□□□ 1.88
IMP4-201ENST00000259239 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.78■■□□□ 1.88
IMP4-201ENST00000259239 DAPK1P53355 1430 aa26.77■■□□□ 1.88
IMP4-201ENST00000259239 ABCC5O15440 1437 aa26.74■■□□□ 1.87
IMP4-201ENST00000259239 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.72■■□□□ 1.87
IMP4-201ENST00000259239 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.71■■□□□ 1.87
IMP4-201ENST00000259239 DIP2BQ9P265 1576 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 ABCC1P33527 1531 aa26.68■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.68■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.68■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.68■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 MBD5Q9P267 1494 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 GLI2P10070 1586 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 FANCAO15360 1455 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 CD109Q6YHK3 1445 aa26.66■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.66■■□□□ 1.86
IMP4-201ENST00000259239 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
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IMP4-201ENST00000259239 HFM1A2PYH4 1435 aa26.64■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.64■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 AKNAQ7Z591 1439 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.62■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.62■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 NAIPQ13075 1403 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 ROCK1Q13464 1354 aa26.59■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.58■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.58■■□□□ 1.85
IMP4-201ENST00000259239 ADGRL2O95490 1459 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 TSPOAP1O95153 1857 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 ADGRL1O94910 1474 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.54■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.53■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 KDM6BO15054 1643 aa26.53■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.53■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 TSPY4P0CV99 314 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 TSPY10P0CW01 314 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 NCOA1Q15788 1441 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-201ENST00000259239 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
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IMP4-201ENST00000259239 NEO1Q92859 1461 aa26.49■■□□□ 1.83
IMP4-201ENST00000259239 PLXNC1O60486 1568 aa26.45■■□□□ 1.83
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IMP4-201ENST00000259239 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.42■■□□□ 1.82
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IMP4-201ENST00000259239 AFAP1Q8N556 730 aa26.42■■□□□ 1.82
IMP4-201ENST00000259239 KIF15Q9NS87 1388 aa26.41■■□□□ 1.82
IMP4-201ENST00000259239 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-201ENST00000259239 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.39■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.38■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 ATP7AQ04656 1500 aa26.37■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 KDM5CP41229 1560 aa26.37■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 RICTORQ6R327 1708 aa26.37■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.36■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.35■■□□□ 1.81
IMP4-201ENST00000259239 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.34■■□□□ 1.81
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IMP4-201ENST00000259239 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.31■■□□□ 1.8
IMP4-201ENST00000259239 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.29■■□□□ 1.8
IMP4-201ENST00000259239 TRIM52Q96A61 297 aa26.27■■□□□ 1.8
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IMP4-201ENST00000259239 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.25■■□□□ 1.79
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IMP4-201ENST00000259239 ABCA6Q8N139 1617 aa26.22■■□□□ 1.79
IMP4-201ENST00000259239 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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IMP4-201ENST00000259239 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.19■■□□□ 1.78
IMP4-201ENST00000259239 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
IMP4-201ENST00000259239 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.17■■□□□ 1.78
IMP4-201ENST00000259239 PZPP20742 1482 aa26.17■■□□□ 1.78
IMP4-201ENST00000259239 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
IMP4-201ENST00000259239 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.16■■□□□ 1.78
IMP4-201ENST00000259239 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.14■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 NUP155O75694 1391 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 A2MP01023 1474 aa26.12■■□□□ 1.77
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