RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258111.4

KCNMB4-201, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNMB4, Length 4,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4-201ENST00000258111 C14orf37Q86TY3 774 aa26.23■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 GGT6Q6P531 493 aa26.23■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 POGKQ9P215 609 aa26.22■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 NUP155O75694 1391 aa26.22■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 FOXD1Q16676 465 aa26.22■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.21■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.21■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.2■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
KCNMB4-201ENST00000258111 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
KCNMB4-201ENST00000258111 TMF1P82094 1093 aa26.17■■□□□ 1.78
KCNMB4-201ENST00000258111 MLECQ14165 292 aa26.15■■□□□ 1.78
KCNMB4-201ENST00000258111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
KCNMB4-201ENST00000258111 CFTRP13569 1480 aa26.14■■□□□ 1.78
KCNMB4-201ENST00000258111 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
KCNMB4-201ENST00000258111 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
KCNMB4-201ENST00000258111 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
KCNMB4-201ENST00000258111 PTPRGP23470 1445 aa26.12■■□□□ 1.77
KCNMB4-201ENST00000258111 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
KCNMB4-201ENST00000258111 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 RALBP1Q15311 655 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 PLEKHG5O94827 1062 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 KIF3BO15066 747 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.05■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 MS4A1P11836 297 aa26.05■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.04■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 HSCBQ8IWL3 235 aa26.04■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
KCNMB4-201ENST00000258111 PDE3BQ13370 1112 aa26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 HMGXB3Q12766 1538 aa26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 NEUROD2Q15784 382 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 CASC1Q6TDU7 716 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 PDE4AP27815 886 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4-201ENST00000258111 GSE1Q14687 1217 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 SYNJ1O43426 1573 aa25.93■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 NESP48681 1621 aa25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 OSCARQ8IYS5 282 aa25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.89■■□□□ 1.74
KCNMB4-201ENST00000258111 KIF21BO75037 1637 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 GRIN2BQ13224 1484 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 PTMSP20962 102 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 NLRP13Q86W25 1043 aa25.87■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 STK26Q9P289 416 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 GBP4Q96PP9 640 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
KCNMB4-201ENST00000258111 MORC1Q86VD1 984 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 A0A0G2JS52 829 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 TOPBP1Q92547 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 TOP2BQ02880 1626 aa25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 PRXQ9BXM0 1461 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 FAM161AQ3B820 660 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.76■■□□□ 1.72
KCNMB4-201ENST00000258111 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.76■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 CUX1P39880 1505 aa25.76■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.75■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA2Q08379 1002 aa25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 CFAP44Q96MT7 982 aa25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 KIF15Q9NS87 1388 aa25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 ARAP1Q96P48 1450 aa25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
KCNMB4-201ENST00000258111 PLCB2Q00722 1185 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms