RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258062.9

REPS1-201, Transcript of RALBP1 associated Eps domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene REPS1, Length 3,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1-201ENST00000258062 ABCC5O15440 1437 aa22.73■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 CCDC184Q52MB2 194 aa22.73■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.73■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.73■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 ROCK1Q13464 1354 aa22.73■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.71■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 CCDC7Q96M83 1385 aa22.71■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 IFT140Q96RY7 1462 aa22.7■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.69■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 DISP1Q96F81 1524 aa22.68■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 NCOA1Q15788 1441 aa22.68■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.67■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 ERCC6Q03468 1493 aa22.66■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 KIAA0556O60303 1618 aa22.65■■□□□ 1.22
REPS1-201ENST00000258062 MRS2Q9HD23 443 aa22.64■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.62■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.61■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.59■■□□□ 1.21
REPS1-201ENST00000258062 GRIN2AQ12879 1464 aa22.58■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 FBLN2P98095 1184 aa22.56■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.55■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.54■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.54■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 PZPP20742 1482 aa22.53■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.52■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 PKD2Q13563 968 aa22.52■■□□□ 1.2
REPS1-201ENST00000258062 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
REPS1-201ENST00000258062 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.49■■□□□ 1.19
REPS1-201ENST00000258062 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.47■■□□□ 1.19
REPS1-201ENST00000258062 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.47■■□□□ 1.19
REPS1-201ENST00000258062 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.47■■□□□ 1.19
REPS1-201ENST00000258062 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.45■■□□□ 1.19
REPS1-201ENST00000258062 USP47Q96K76 1375 aa22.44■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 JPH4Q96JJ6 628 aa22.44■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 KIF14Q15058 1648 aa22.42■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.41■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.4■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 CEP170Q5SW79 1584 aa22.4■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 ADGRL2O95490 1459 aa22.4■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.39■■□□□ 1.18
REPS1-201ENST00000258062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.39■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 MBD5Q9P267 1494 aa22.39■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 NUP155O75694 1391 aa22.38■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 SYNJ2O15056 1496 aa22.38■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 MSH5O43196 834 aa22.38■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.36■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.35■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.34■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 TSPY4P0CV99 314 aa22.34■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 TSPY10P0CW01 314 aa22.34■■□□□ 1.17
REPS1-201ENST00000258062 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.32■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.32■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.32■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.31■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.31■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.168e-6■■■■□ 21.3
REPS1-201ENST00000258062 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.29■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 NUP160Q12769 1436 aa22.28■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 ATP10BO94823 1461 aa22.27■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 TMC1Q8TDI8 760 aa22.27■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.27■■□□□ 1.16
REPS1-201ENST00000258062 KDM5CP41229 1560 aa22.26■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.26■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.26■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 NUDCQ9Y266 331 aa22.26■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.25■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 KIF15Q9NS87 1388 aa22.24■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.24■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.23■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.22■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 ABCA8O94911 1581 aa22.21■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.21■■□□□ 1.15
REPS1-201ENST00000258062 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.17■■□□□ 1.14
REPS1-201ENST00000258062 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.13■■□□□ 1.13
REPS1-201ENST00000258062 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.13■■□□□ 1.13
REPS1-201ENST00000258062 RGL3Q3MIN7 710 aa22.13■■□□□ 1.13
REPS1-201ENST00000258062 PTPRGP23470 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
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