RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD11-201ENST00000249504 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD11-201ENST00000249504 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD11-201ENST00000249504 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXD11-201ENST00000249504 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXD11-201ENST00000249504 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
HOXD11-201ENST00000249504 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXD11-201ENST00000249504 AKNAQ7Z591 1439 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD11-201ENST00000249504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRL1O94910 1474 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXD11-201ENST00000249504 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
HOXD11-201ENST00000249504 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXD11-201ENST00000249504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXD11-201ENST00000249504 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXD11-201ENST00000249504 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC1P33527 1531 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXD11-201ENST00000249504 RICTORQ6R327 1708 aa30■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 RAPGEF3O95398 923 aa30■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 MIA2Q96PC5 1412 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXD11-201ENST00000249504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.94■■■□□ 2.38
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HOXD11-201ENST00000249504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.93■■■□□ 2.38
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HOXD11-201ENST00000249504 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.89■■■□□ 2.38
HOXD11-201ENST00000249504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.89■■■□□ 2.38
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HOXD11-201ENST00000249504 KDM5CP41229 1560 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD11-201ENST00000249504 MBD5Q9P267 1494 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXD11-201ENST00000249504 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
HOXD11-201ENST00000249504 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD11-201ENST00000249504 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.75■■■□□ 2.35
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HOXD11-201ENST00000249504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
HOXD11-201ENST00000249504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXD11-201ENST00000249504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXD11-201ENST00000249504 ATP7AQ04656 1500 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD11-201ENST00000249504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
HOXD11-201ENST00000249504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
HOXD11-201ENST00000249504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
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HOXD11-201ENST00000249504 TSPY10P0CW01 314 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA6Q8N139 1617 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 DAPK1P53355 1430 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 ATP10AO60312 1499 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC5O15440 1437 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD11-201ENST00000249504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD11-201ENST00000249504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD11-201ENST00000249504 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 REREQ9P2R6 1566 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 PLXNC1O60486 1568 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 A2MP01023 1474 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.51■■■□□ 2.32
HOXD11-201ENST00000249504 ITGAEP38570 1179 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.48■■■□□ 2.31
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HOXD11-201ENST00000249504 AGLP35573 1532 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRL2O95490 1459 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD11-201ENST00000249504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.45■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 KIF15Q9NS87 1388 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 NCOA1Q15788 1441 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 MLECQ14165 292 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD11-201ENST00000249504 ROCK1Q13464 1354 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD11-201ENST00000249504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXD11-201ENST00000249504 ERBINQ96RT1 1412 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD11-201ENST00000249504 KIF3BO15066 747 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 MADDQ8WXG6 1647 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 GGT6Q6P531 493 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.26■■■□□ 2.27
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