RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PREX2Q70Z35 1606 aa35.23■■■■□ 3.23
SYF2-201ENST00000236273 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SYF2-201ENST00000236273 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.22■■■■□ 3.23
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.21■■■■□ 3.23
SYF2-201ENST00000236273 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.21■■■■□ 3.23
SYF2-201ENST00000236273 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
SYF2-201ENST00000236273 ADGRL1O94910 1474 aa35.18■■■■□ 3.22
SYF2-201ENST00000236273 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.16■■■■□ 3.22
SYF2-201ENST00000236273 RICTORQ6R327 1708 aa35.16■■■■□ 3.22
SYF2-201ENST00000236273 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.13■■■■□ 3.21
SYF2-201ENST00000236273 NCOA2Q15596 1464 aa35.12■■■■□ 3.21
SYF2-201ENST00000236273 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.08■■■■□ 3.21
SYF2-201ENST00000236273 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.07■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.04■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 ABCC1P33527 1531 aa35.04■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 APLP2Q06481 763 aa35.03■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.01■■■■□ 3.2
SYF2-201ENST00000236273 AFAP1Q8N556 730 aa35■■■■□ 3.19
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.98■■■■□ 3.19
SYF2-201ENST00000236273 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.97■■■■□ 3.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.94■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 KDM5CP41229 1560 aa34.94■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.93■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.93■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.92■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.9■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.9■■■■□ 3.18
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.88■■■■□ 3.17
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.88■■■■□ 3.17
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.87■■■■□ 3.17
SYF2-201ENST00000236273 MBD5Q9P267 1494 aa34.85■■■■□ 3.17
SYF2-201ENST00000236273 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.84■■■■□ 3.17
SYF2-201ENST00000236273 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.83■■■■□ 3.17
SYF2-201ENST00000236273 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.79■■■■□ 3.16
SYF2-201ENST00000236273 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.79■■■■□ 3.16
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.78■■■■□ 3.16
SYF2-201ENST00000236273 MIA2Q96PC5 1412 aa34.77■■■■□ 3.16
SYF2-201ENST00000236273 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.76■■■■□ 3.16
SYF2-201ENST00000236273 ATP10AO60312 1499 aa34.75■■■■□ 3.15
SYF2-201ENST00000236273 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.72■■■■□ 3.15
SYF2-201ENST00000236273 ABCA6Q8N139 1617 aa34.71■■■■□ 3.15
SYF2-201ENST00000236273 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
SYF2-201ENST00000236273 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.68■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.67■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.65■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.65■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.65■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.64■■■■□ 3.14
SYF2-201ENST00000236273 ATP7AQ04656 1500 aa34.63■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.62■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 REREQ9P2R6 1566 aa34.62■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.61■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.6■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.59■■■■□ 3.13
SYF2-201ENST00000236273 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
SYF2-201ENST00000236273 AGLP35573 1532 aa34.51■■■■□ 3.12
SYF2-201ENST00000236273 TSPY4P0CV99 314 aa34.5■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 TSPY10P0CW01 314 aa34.5■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 ABCC5O15440 1437 aa34.48■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 MLECQ14165 292 aa34.48■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.47■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 A2MP01023 1474 aa34.47■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 MADDQ8WXG6 1647 aa34.47■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 PLXNC1O60486 1568 aa34.46■■■■□ 3.11
SYF2-201ENST00000236273 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.44■■■■□ 3.1
SYF2-201ENST00000236273 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SYF2-201ENST00000236273 DAPK1P53355 1430 aa34.41■■■■□ 3.1
SYF2-201ENST00000236273 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SYF2-201ENST00000236273 PTPRMP28827 1452 aa34.39■■■■□ 3.1
SYF2-201ENST00000236273 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.38■■■■□ 3.09
SYF2-201ENST00000236273 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
SYF2-201ENST00000236273 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.37■■■■□ 3.09
SYF2-201ENST00000236273 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
SYF2-201ENST00000236273 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.33■■■■□ 3.09
SYF2-201ENST00000236273 PTPRKQ15262 1439 aa34.27■■■■□ 3.08
SYF2-201ENST00000236273 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.27■■■■□ 3.08
SYF2-201ENST00000236273 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
SYF2-201ENST00000236273 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
SYF2-201ENST00000236273 GGT6Q6P531 493 aa34.23■■■■□ 3.07
SYF2-201ENST00000236273 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.23■■■■□ 3.07
SYF2-201ENST00000236273 KIF3BO15066 747 aa34.22■■■■□ 3.07
SYF2-201ENST00000236273 NCOA1Q15788 1441 aa34.22■■■■□ 3.07
SYF2-201ENST00000236273 KIF15Q9NS87 1388 aa34.21■■■■□ 3.07
SYF2-201ENST00000236273 ADGRL2O95490 1459 aa34.19■■■■□ 3.06
SYF2-201ENST00000236273 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.19■■■■□ 3.06
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.17■■■■□ 3.06
SYF2-201ENST00000236273 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
SYF2-201ENST00000236273 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.15■■■■□ 3.06
SYF2-201ENST00000236273 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.12■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms