RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224652.10

ATE1-201, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATE1, Length 4,930 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-201ENST00000224652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 MAPKBP1O60336 1514 aa19.6■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 IQGAP2Q13576 1575 aa19.6■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.73
ATE1-201ENST00000224652 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 PTPRKQ15262 1439 aa19.57■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 HECW1Q76N89 1606 aa19.57■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 PTPRGP23470 1445 aa19.56■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 MIA2Q96PC5 1412 aa19.53■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.53■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.52■□□□□ 0.72
ATE1-201ENST00000224652 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.51■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.51■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.48■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.48■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.48■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 DAPK1P53355 1430 aa19.47■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.46■□□□□ 0.71
ATE1-201ENST00000224652 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.44■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 GRIN2AQ12879 1464 aa19.44■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.43■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.43■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.43■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.43■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.42■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.42■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 CCDC7Q96M83 1385 aa19.42■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 USP47Q96K76 1375 aa19.42■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.41■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 KIF15Q9NS87 1388 aa19.4■□□□□ 0.7
ATE1-201ENST00000224652 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.39■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 ABCC5O15440 1437 aa19.39■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.38■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.38■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.38■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 BCL11AQ9H165 835 aa19.37■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.35■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.34■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 SYNJ2O15056 1496 aa19.34■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 TMF1P82094 1093 aa19.33■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
ATE1-201ENST00000224652 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 CCDC184Q52MB2 194 aa19.33■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 ROCK1Q13464 1354 aa19.32■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.32■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 ADAMTS12P58397 1594 aa19.32■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.31■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.3■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 SAMD9Q5K651 1589 aa19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 KIF3BO15066 747 aa19.29■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 ARHGEF11O15085 1522 aa19.27■□□□□ 0.68
ATE1-201ENST00000224652 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.26■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 AKNAQ7Z591 1439 aa19.26■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 CDCA8Q53HL2 280 aa19.25■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.25■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 NCOA1Q15788 1441 aa19.24■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 KANK1Q14678 1352 aa19.24■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 WDR62O43379 1518 aa19.24■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 GGT6Q6P531 493 aa19.24■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 RALBP1Q15311 655 aa19.23■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 PBRM1Q86U86 1689 aa19.22■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.21■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.21■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
ATE1-201ENST00000224652 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.21■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 KIAA0556O60303 1618 aa19.2■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 AFAP1Q8N556 730 aa19.19■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 NUDCQ9Y266 331 aa19.19■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 DISP1Q96F81 1524 aa19.19■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.18■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 PANK3Q9H999 370 aa19.17■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 NLRP13Q86W25 1043 aa19.17■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ATE1-201ENST00000224652 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.13■□□□□ 0.65
ATE1-201ENST00000224652 NEUROD2Q15784 382 aa19.12■□□□□ 0.65
ATE1-201ENST00000224652 ATP10BO94823 1461 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.9 ms