RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.06■■■□□ 2.08
PLGRKT-201ENST00000223864 HECW1Q76N89 1606 aa28.03■■■□□ 2.08
PLGRKT-201ENST00000223864 ATXN8OSP0DMR3 200 aa28.01■■■□□ 2.07
PLGRKT-201ENST00000223864 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PLGRKT-201ENST00000223864 APLP2Q06481 763 aa28■■■□□ 2.07
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PLGRKT-201ENST00000223864 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.94■■■□□ 2.06
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.94■■■□□ 2.06
PLGRKT-201ENST00000223864 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.94■■■□□ 2.06
PLGRKT-201ENST00000223864 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
PLGRKT-201ENST00000223864 NEO1Q92859 1461 aa27.9■■■□□ 2.06
PLGRKT-201ENST00000223864 CLIP1P30622 1438 aa27.9■■■□□ 2.06
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.87■■■□□ 2.05
PLGRKT-201ENST00000223864 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PLGRKT-201ENST00000223864 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.86■■■□□ 2.05
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PLGRKT-201ENST00000223864 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PLGRKT-201ENST00000223864 DSG3P32926 999 aa27.84■■■□□ 2.05
PLGRKT-201ENST00000223864 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.82■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.81■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.79■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 FANCAO15360 1455 aa27.78■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.78■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.77■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF14Q15058 1648 aa27.77■■■□□ 2.04
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCB7O75027 752 aa27.76■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 AKNAQ7Z591 1439 aa27.75■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 RAPGEF3O95398 923 aa27.74■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 PLCH2O75038 1416 aa27.74■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.73■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRL1O94910 1474 aa27.72■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 RICTORQ6R327 1708 aa27.71■■■□□ 2.03
PLGRKT-201ENST00000223864 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP162Q5TB80 1403 aa27.68■■■□□ 2.02
PLGRKT-201ENST00000223864 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.63■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.61■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.61■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.58■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.58■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.58■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 POLA2Q14181 598 aa27.58■■■□□ 2.01
PLGRKT-201ENST00000223864 PREX2Q70Z35 1606 aa27.57■■■□□ 2
PLGRKT-201ENST00000223864 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.56■■■□□ 2
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.55■■■□□ 2
PLGRKT-201ENST00000223864 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.53■■■□□ 2
PLGRKT-201ENST00000223864 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.51■■■□□ 2
PLGRKT-201ENST00000223864 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.49■■□□□ 1.99
PLGRKT-201ENST00000223864 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.46■■□□□ 1.99
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.46■■□□□ 1.99
PLGRKT-201ENST00000223864 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.45■■□□□ 1.99
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.44■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.44■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM5CP41229 1560 aa27.42■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.42■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC1P33527 1531 aa27.41■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.41■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 AFAP1Q8N556 730 aa27.39■■□□□ 1.98
PLGRKT-201ENST00000223864 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.39■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.38■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.37■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.36■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.35■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.35■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP10AO60312 1499 aa27.35■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 TIAM1Q13009 1591 aa27.34■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.33■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 MADDQ8WXG6 1647 aa27.33■■□□□ 1.97
PLGRKT-201ENST00000223864 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.32■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.31■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPRMP28827 1452 aa27.29■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.28■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.27■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.27■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.27■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PLGRKT-201ENST00000223864 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.26■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCA6Q8N139 1617 aa27.26■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.25■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 REREQ9P2R6 1566 aa27.24■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K1Q13233 1512 aa27.24■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 NCOA2Q15596 1464 aa27.23■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.22■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.2■■□□□ 1.95
PLGRKT-201ENST00000223864 MLECQ14165 292 aa27.19■■□□□ 1.94
PLGRKT-201ENST00000223864 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PLGRKT-201ENST00000223864 AGLP35573 1532 aa27.14■■□□□ 1.94
PLGRKT-201ENST00000223864 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP7AQ04656 1500 aa27.13■■□□□ 1.93
PLGRKT-201ENST00000223864 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PLGRKT-201ENST00000223864 MBD5Q9P267 1494 aa27.11■■□□□ 1.93
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.07■■□□□ 1.92
PLGRKT-201ENST00000223864 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms