RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000196489.3

ZNF416-201, Transcript of zinc finger protein 416, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF416, Length 2,561 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF416-201ENST00000196489 SYNJ2O15056 1496 aa25.36■■□□□ 1.65
ZNF416-201ENST00000196489 ABCC5O15440 1437 aa25.36■■□□□ 1.65
ZNF416-201ENST00000196489 ANP32CO43423 234 aa25.35■■□□□ 1.65
ZNF416-201ENST00000196489 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
ZNF416-201ENST00000196489 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 JPH4Q96JJ6 628 aa25.32■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.28■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 ROCK1Q13464 1354 aa25.28■■□□□ 1.64
ZNF416-201ENST00000196489 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.24■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 KIF14Q15058 1648 aa25.24■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.24■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 NUP160Q12769 1436 aa25.23■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 CCER2I3L3R5 266 aa25.22■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
ZNF416-201ENST00000196489 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.19■■□□□ 1.62
ZNF416-201ENST00000196489 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.19■■□□□ 1.62
ZNF416-201ENST00000196489 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
ZNF416-201ENST00000196489 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.14■■□□□ 1.62
ZNF416-201ENST00000196489 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.13■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.12■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 NCOA1Q15788 1441 aa25.12■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 BCANQ96GW7 911 aa25.09■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 PZPP20742 1482 aa25.09■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.09■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ZNF416-201ENST00000196489 ATP10BO94823 1461 aa25.08■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 ABCA8O94911 1581 aa25.06■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 FKBP8Q14318 412 aa25.04■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 PKD2Q13563 968 aa25.02■■□□□ 1.6
ZNF416-201ENST00000196489 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 ADGRL2O95490 1459 aa25■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.99■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.98■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 CCDC7Q96M83 1385 aa24.98■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 PTPRGP23470 1445 aa24.97■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.96■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.96■■□□□ 1.59
ZNF416-201ENST00000196489 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.95■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 CCDC184Q52MB2 194 aa24.94■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 TSPY4P0CV99 314 aa24.92■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 TSPY10P0CW01 314 aa24.92■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 NUP155O75694 1391 aa24.92■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.9■■□□□ 1.58
ZNF416-201ENST00000196489 NEFLP07196 543 aa24.89■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.88■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 KIF15Q9NS87 1388 aa24.85■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.85■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 CHD1O14646 1710 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 MBD5Q9P267 1494 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF416-201ENST00000196489 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.82■■□□□ 1.56
ZNF416-201ENST00000196489 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF416-201ENST00000196489 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.79■■□□□ 1.56
ZNF416-201ENST00000196489 USP47Q96K76 1375 aa24.79■■□□□ 1.56
ZNF416-201ENST00000196489 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.78■■□□□ 1.56
ZNF416-201ENST00000196489 MRS2Q9HD23 443 aa24.78■■□□□ 1.56
ZNF416-201ENST00000196489 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.74■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.74■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 PREX2Q70Z35 1606 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF416-201ENST00000196489 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.7■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.7■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.7■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.69■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 KDM5CP41229 1560 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 SHROOM2Q13796 1616 aa24.66■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.65■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.64■■□□□ 1.54
ZNF416-201ENST00000196489 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.64■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.63■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 RGL3Q3MIN7 710 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 ABCC2Q92887 1545 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.6■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.6■■□□□ 1.53
ZNF416-201ENST00000196489 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.56■■□□□ 1.52
ZNF416-201ENST00000196489 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms