RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MRS3	P10566	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	YME1	P32795	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	SHP1	P34223	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PRD1	P25375	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	VPS52	P39904	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	YEL057C	P39983	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	SPO22	P40511	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PET130	P47065	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	FOB1	O13329	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	BNA4	P38169	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
snR34	snR34	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MET28	P40573	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
snR34	snR34	IVY1	Q04934	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	ARG3	P05150	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PHO2	P07269	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MRP7	P12687	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	CST26	P38226	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	SLD5	Q03406	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	YCR007C	P25354	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	NDC1	P32500	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	FRE1	P32791	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PTR2	P32901	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MUM2	P38236	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	RPM2	Q02773	1202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	YDR239C	Q03780	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	COG4	Q06096	861 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	SUC2	P00724	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	COR1	P07256	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	RPN12	P32496	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MRE11	P32829	692 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	MSN2	P33748	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	DUG2	P38149	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	NDE1	P40215	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	ESL1	P40456	1118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
snR34	snR34	YDL009C	Q12210	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	RAV1	P47104	1357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR34	snR34	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MDM31	P38880	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RTT101	P47050	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	BNA5	Q05979	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	PHO92	Q06390	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	SYO1	Q07395	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	BUD14	P27637	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	UTR4	P32626	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	VPS72	Q03388	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	PDS5	Q04264	1277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RTT103	Q05543	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	SEC39	Q12745	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YML133C	Q03099	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ATS1	P31386	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MBB1	P39534	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ERP2	P39704	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MET18	P40469	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	IRC6	P43615	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	GPI1	P53306	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	PPT2	Q12036	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ATG29	Q12092	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	SET6	Q12529	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	GPI10	P30777	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	SPC110	P32380	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	VID24	P38263	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RPR2	P40571	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	TWF1	P53250	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR34	snR34	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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