RNA–Protein interactions for RNA: YMR078C

CTF18, Transcript of Subunit of a complex with Ctf8p, yeast

Gene CTF18, Length 2,226 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF18	YMR078C	COR1	P07256	457 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	MBB1	P39534	108 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SHR3	Q02774	210 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SSK1	Q07084	712 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	THP1	Q08231	455 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SUC2	P00724	532 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SHP1	P34223	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	DSE3	Q08729	430 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	RGT2	Q12300	763 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ATO2	P32907	282 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	MSN2	P33748	704 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	GUF1	P46943	645 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ATG27	P46989	271 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ERP4	Q12450	207 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SNT1	P25357	1226 aa		5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	RSF1	Q05043	376 aa		5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	RRD2	Q12461	358 aa		5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	PDX1	P16451	410 aa		5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YMR087W	Q04299	284 aa		5	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	BAR1	P12630	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YCR043C	P25361	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	DUG2	P38149	878 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	BNA4	P38169	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	THI20	Q08224	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	AFT2	Q08957	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	CLB3	P24870	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ADK2	P26364	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	PPZ1	P26570	692 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SNA4	Q07549	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	FMP45	Q07651	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	HNM1	P19807	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	TYR1	P20049	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ACH1	P32316	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YGL108C	P53139	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ARP6	Q12509	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	MSS11	Q03825	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	SRL1	Q08673	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	RAV1	P47104	1357 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CTF18	YMR078C	PPH22	P23595	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YND1	P40009	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SAM50	P53969	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RBA50	Q04418	439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YIM1	P28625	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ATP11	P32453	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ALT2	P52892	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	GCS1	P35197	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	STB6	P36085	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SYG1	P40528	902 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SLD5	Q03406	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	APE1	P14904	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RAD24	P32641	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	MET30	P39014	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	AZF1	P41696	914 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
CTF18	YMR078C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	BNA5	Q05979	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	VTA1	Q06263	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	PHO92	Q06390	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RKM5	Q12367	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	GLN3	P18494	730 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RML2	P32611	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	UTR4	P32626	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ECM15	P35195	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	TUL1	P36096	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YIL169C	P40442	995 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YIR014W	P40570	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	HOM3	P10869	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YGR149W	P48236	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RSC1	P53236	928 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ROY1	Q04847	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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