RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 ATM1P40416 690 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 CCT8P47079 568 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 LSM8P47093 109 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 RSN1Q03516 953 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 MDM32Q12171 622 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 ATG34Q12292 412 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 ABF1P14164 731 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data9.47□□□□□ -0.89not detected
RDN25-2RDN25-2 CCA1P21269 546 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 HRR25P29295 494 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 SBE22P38814 852 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 SLX8P40072 274 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 GPI1P53306 609 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 YNG1Q08465 219 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 CHS1P08004 1131 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 PUT4P15380 627 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 RPL24BP24000 155 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 UTP9P38882 575 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 ECM10P39987 644 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 PIG2P40187 538 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 TED1P40533 473 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 COS4P43542 379 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 COS1P53822 381 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 NSE5Q03718 556 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 YMR321CQ04898 105 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 CRN1Q06440 651 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 SKM1Q12469 655 aa9.46□□□□□ -0.89
RDN25-2RDN25-2 ARO3P14843 370 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 IXR1P33417 597 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 MRPL7P36519 292 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 GPB2P39717 880 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SEH1P53011 349 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SCS3P53012 380 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 MNT4P53745 580 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 NDI1P32340 513 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 APT2P36973 181 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SRP68P38687 599 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 LNP1P38878 278 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ARL3Q02804 198 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ATG20Q07528 640 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ESA1Q08649 445 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 RIF1P29539 1916 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 TRP3P00937 484 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 UBC8P28263 218 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SLI15P38283 698 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 RIM11P38615 370 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ATG7P38862 630 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 HMF1P40037 129 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 MRPS18P42847 217 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 MHR1Q06630 226 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 TY3A-GQ12173 290 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 TY3A-IQ99219 290 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SGV1P23293 657 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 RSC6P25632 483 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 CEM1P39525 442 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ERP2P39704 215 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ERG10P41338 398 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ARC1P46672 376 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 PFD1P46988 109 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 YJL049WP47048 450 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 MNT2P53059 558 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 NOP19P53317 196 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 BUD32P53323 261 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 YNL010WP53981 241 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SRP1Q02821 542 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SEG1Q04279 960 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 YOL159CQ08300 171 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 YCL001W-BQ96VH2 84 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 GOS1P38736 223 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 EMP65P40085 556 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 AGE2P40529 298 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 GET1P53192 235 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SPC98P53540 846 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 ATP14Q12349 124 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 PRP28P23394 588 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 NOP4P37838 685 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SEA4P38164 1038 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 PRS2P38620 318 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 IMD2P38697 523 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 YHR131CP38835 850 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 COG1P53079 417 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 TWF1P53250 332 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 TIM13P53299 105 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SPP1Q03012 353 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 TIM9O74700 87 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 PPE1P38796 400 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 GLG2P47011 380 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SLD7Q08457 257 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 FRE3Q08905 711 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 DGK1Q12382 290 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 PCD1Q12524 340 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 CSR2Q12734 1121 aa9.44□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 CMK2P22517 447 aa9.43□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SAT4P25333 603 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SKG1P36169 355 aa9.43□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 YHR045WP38775 560 aa9.43□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 SOK1P40317 901 aa9.43□□□□□ -0.9
RDN25-2RDN25-2 EGD1Q02642 157 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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