RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	NMD5	P46970	1048 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BRO1	P48582	844 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COS12	P53053	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MPS2	P53159	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COX18	P53239	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGR126W	P53274	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RTT102	P53330	157 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	INA17	Q02888	182 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SMA2	Q04658	369 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RRN11	Q04712	507 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TUP1	P16649	713 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	VMA16	P23968	213 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YHR045W	P38775	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CTF8	P38877	133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	END3	P39013	349 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CIN1	P40987	1014 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PFA3	P42836	336 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	OTU1	P43558	301 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	IDS2	P46958	469 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YHC3	P47040	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	URB2	P47108	1174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGL114W	P53134	725 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGR117C	P53270	476 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	LSC2	P53312	427 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ESBP6	P53918	673 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
TOP1	YOL006C	MUK1	Q02866	612 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SRL4	Q03085	281 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RSM28	Q03430	361 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YMR130W	Q04223	302 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STE23	Q06010	1027 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MCM21	Q06675	368 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	LOT6	Q07923	191 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MED2	Q12124	431 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SLP1	Q12232	587 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PDE2	P06776	526 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GAL3	P13045	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	KIN82	P25341	720 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ADY2	P25613	283 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YHR182W	P38870	785 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YJL206C	P39529	758 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	IRC8	P47046	822 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COS5	P47187	383 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TOM22	P49334	152 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ARR2	Q06597	130 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COS7	Q07788	383 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	DFG16	Q99234	619 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SAG1	P20840	650 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FPS1	P23900	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BEM1	P29366	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	OCT1	P35999	772 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	APT2	P36973	181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MNN2	P38069	597 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SWC5	P38326	303 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STB2	P46679	850 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	NET1	P47035	1189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BIO3	P50277	480 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGR012W	P53206	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COQ6	P53318	479 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	IPI3	P53877	555 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YDR444W	Q04093	687 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HOF1	Q05080	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SIL1	Q08199	421 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CDC23	P16522	626 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SEC62	P21825	274 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HXT1	P32465	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TOS1	P38288	455 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RCY1	P39531	840 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MTW1	P39731	289 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YIP5	P53108	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HST3	P53687	447 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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