RNA–Protein interactions for RNA: YJL062W

LAS21, Transcript of Integral plasma membrane protein, yeast

Gene LAS21, Length 2,493 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS21	YJL062W	MEF2	P39677	819 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	TYW3	P53177	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	ALF1	P53904	254 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	ISU1	Q03020	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	LAG2	Q92325	660 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	SPO16	P17122	198 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	MRPS28	P21771	286 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	YCR015C	P25616	317 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	PSY4	P38193	441 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	RGI2	P40188	164 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	ELP2	P42935	788 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	SAE2	P46946	345 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	FRE4	P53746	719 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	ROT1	Q03691	256 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	RAD33	Q04231	177 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	GRS2	Q06817	618 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
LAS21	YJL062W	NRT1	Q08485	598 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	MCA1	Q08601	432 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	MCD1	Q12158	566 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LAS21	YJL062W	SWI5	P08153	709 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RPC37	P36121	282 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YHR182W	P38870	785 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	ARG2	P40360	574 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YIL086C	P40503	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	IRR1	P40541	1150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	IME4	P41833	600 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YFR020W	P43600	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SAP4	P53036	818 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	NGL3	Q03210	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	ARP9	Q05123	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	PUN1	Q06991	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	ADY3	Q07732	790 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	VAN1	P23642	535 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	KIP2	P28743	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YKL100C	P34248	587 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	STB6	P36085	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SPC72	P39723	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RET2	P43621	546 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	NUP100	Q02629	959 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	KRE28	Q04431	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	TMA16	Q08687	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	HUA2	Q12134	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	CDC9	P04819	755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SFL1	P20134	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	DBF4	P32325	704 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	BEM4	P39011	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YAT2	P40017	923 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SER3	P40054	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RPC17	P47076	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SWA2	Q06677	668 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RSC58	Q07979	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	ATG9	Q12142	997 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	STE6	P12866	1290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YCL042W	P25572	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	DAL80	P26343	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	DBF20	P32328	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
LAS21	YJL062W	ECM4	P36156	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YRO2	P38079	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	LDB7	P38210	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YJR030C	P47101	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YGR012W	P53206	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
LAS21	YJL062W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	SPC19	Q03954	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	ARR1	Q06596	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	IRC13	Q08630	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	RAD1	P06777	1100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS21	YJL062W	PMR1	P13586	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms