RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	YLL066C	Q99208	1374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	STE2	D6VTK4	431 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	HIP1	P06775	603 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SEC12	P11655	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	CDC42	P19073	191 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PRD1	P25375	712 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YIH1	P25637	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	KRE6	P32486	720 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	COT1	P32798	439 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MRE11	P32829	692 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YME2	P32843	850 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MRPL37	P36532	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	THI2	P38141	450 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MMS4	P38257	691 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	IME4	P41833	600 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	HXT14	P42833	540 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	VID30	P53076	958 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	HOP2	P53187	214 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SPC98	P53540	846 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SNZ1	Q03148	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	VPS20	Q04272	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	UFO1	Q04511	668 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	AIM41	Q12032	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	UNG1	P12887	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	BOS1	P25385	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	BUD14	P27637	709 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	HCS1	P34243	683 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PXL1	P36166	706 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MRPL4	P36517	319 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	TCD1	P38756	429 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	CCT6	P39079	546 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MIT1	P40002	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PMT6	P42934	759 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PNG1	Q02890	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ARR1	Q06596	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SPO11	P23179	398 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PPZ2	P33329	710 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MSN4	P33749	630 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	AGP2	P38090	596 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PIH1	P38768	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ELP2	P42935	788 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	IDS2	P46958	469 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	CTK2	P46962	323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YDL183C	P48569	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YGL242C	P53066	181 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ATC1	Q04005	294 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YLR297W	Q05899	129 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	GSH2	Q08220	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	LDB17	Q12342	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	BNR1	P40450	1375 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	VPS63	O13549	108 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ADY2	P25613	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RML2	P32611	393 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	TPO5	P36029	618 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	MRPL7	P36519	292 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YMC2	P38087	329 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PFF1	P38244	976 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	EHT1	P38295	451 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RFC3	P38629	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SSO2	P39926	295 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YEL020C	P39994	560 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SMC3	P47037	1230 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	PRM1	P53835	661 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YNL050C	P53952	270 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	SEG1	Q04279	960 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	CSI1	Q04368	295 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	ULA1	Q12059	462 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECM1	YAL059W	STE3	P06783	470 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECM1	YAL059W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61

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