RNA–Protein interactions for RNA: YNL266W

YNL266W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL266W, Length 420 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL266W	YNL266W	SDH3	P33421	198 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	LAG1	P38703	411 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	OCA5	P38738	679 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	CAB2	P40506	365 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	YFL067W	P43537	175 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	YGR237C	P50089	785 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	TOF1	P53840	1238 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	VHS1	Q03785	461 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	GLO2	Q05584	274 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	BNA5	Q05979	453 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	PEX15	Q08215	383 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	SWT1	Q12104	458 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL266W	YNL266W	FMT1	P32785	401 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SDS22	P36047	338 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ROT2	P38138	954 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SEO1	P39709	593 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PAN6	P40459	309 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YPL014W	Q02606	381 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	TRE2	Q08693	809 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	NUR1	Q12066	484 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.26	□□□□□ -2.37	not detected
YNL266W	YNL266W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ESL2	P36168	1195 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ANS1	P38832	159 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YHR131C	P38835	850 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	UBP12	P39538	1254 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	FMP10	P40098	244 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	RHO4	Q00246	291 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PEX25	Q02969	394 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SLX4	Q12098	748 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	DAL2	P25335	343 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	DUG2	P38149	878 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YPS6	P40583	537 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SMC3	P47037	1230 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YMR160W	Q03823	816 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	MLC2	Q06580	163 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SIR1	P21691	654 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YCK1	P23291	538 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	RIT1	P23796	513 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	NUP2	P32499	720 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	FRE1	P32791	686 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	KKQ8	P36004	724 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	MRPS9	P38120	278 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SAW1	P39735	261 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PKP1	P40530	394 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	not detected
YNL266W	YNL266W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	AIM32	Q04689	311 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	VPS74	Q06385	345 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	FDH1	Q08911	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	APL4	Q12028	832 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ATG9	Q12142	997 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PUT2	P07275	575 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	MRPL10	P36520	322 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ARA1	P38115	344 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	TIM17	P39515	158 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	BRO1	P48582	844 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ALG12	P53730	551 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	CAF40	P53829	373 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	IRC15	Q02733	499 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	PIR3	Q03180	325 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YKU80	Q04437	629 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	YLR108C	Q12259	485 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	MAS2	P11914	482 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	SPO16	P17122	198 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	NAT2	P37293	288 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	GAB1	P41733	394 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ERR3	P42222	437 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	GWT1	P47026	490 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	IMA1	P53051	589 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	FLC3	P53121	802 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	ZDS2	P54786	942 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL266W	YNL266W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL266W	YNL266W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL266W	YNL266W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL266W	YNL266W	YKL050C	P35736	922 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL266W	YNL266W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL266W	YNL266W	MSG5	P38590	489 aa		0.21	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.3 ms