RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W VPS9P54787 451 aa2.9□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MSH6Q03834 1242 aa2.9□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YMR321CQ04898 105 aa2.9□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NBP2Q12163 236 aa2.9□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MIS1P09440 975 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YCK1P23291 538 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MKK2P32491 506 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YDR056CQ12025 205 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W AI1P03875 834 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DCG1P32460 244 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W BEM3P32873 1128 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W VID24P38263 362 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TDA11P38854 504 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NIT2P47016 307 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YML6P51998 286 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YPR114WQ06107 315 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YOR296WQ08748 1289 aa2.9□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HSL7P38274 827 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W FTH1P38310 465 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TEP1P53916 434 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CIK1Q01649 594 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HAP5Q02516 242 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GAL3P13045 520 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RAD24P32641 659 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W NCL1P38205 684 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W KAP104P38217 918 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CCZ1P38273 704 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W STT3P39007 718 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GTS1P40956 396 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MID1P41821 548 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SHE4P51534 789 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W COS12P53053 380 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YGR016WP53209 190 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PRM15Q03262 622 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W VTI1Q04338 217 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CIA1Q05583 330 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W VTA1Q06263 330 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ADY3Q07732 790 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W COQ4O13525 335 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CNS1P33313 385 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GMH1P36125 273 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W BCD1P38772 366 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SEC26P41810 973 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PFD1P46988 109 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ROD1Q02805 837 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W AGE1Q04412 482 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MFG1Q07684 458 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GUP2Q08929 609 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W APL4Q12028 832 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W IMG1P25626 169 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SPC29P33419 253 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W TSC10P38342 320 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ALY2P47029 1046 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SWC4P53201 476 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MRPL13Q02204 264 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GTB1Q04924 702 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HDA2Q06629 674 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SHS1Q07657 551 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DSE3Q08729 430 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YRM1Q12340 786 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ZRT2Q12436 422 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W APM4Q99186 491 aa2.89□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W ECM13P38195 257 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YHR045WP38775 560 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W PFS1P38872 237 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SPT8P38915 602 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W AKR1P39010 764 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RGD2P43556 714 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W YLR012CQ07927 99 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W REV1P12689 985 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GLN3P18494 730 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W RIT1P23796 513 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SKN7P38889 622 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W CCT3P39077 534 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SIT1P39980 628 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MEP1P40260 492 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SPO22P40511 975 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W DJP1P40564 432 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W SHR5P41912 237 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GPG1P53130 126 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W HOT1Q03213 719 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MLH3Q12083 715 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W GRX2P17695 143 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MDJ1P35191 511 aa2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data2.88□□□□□ -1.95 RIP-Chip
SIN3YOL004W SAP1P39955 897 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SIN3YOL004W LSM4P40070 187 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
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