RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PMT1	P33775	817 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DUG2	P38149	878 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CST26	P38226	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	STB5	P38699	743 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
CLF1	YLR117C	TIR3	P40552	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FAR3	P46671	204 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MNT2	P53059	558 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YGL138C	P53122	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YML131W	Q03102	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPD1	Q07688	167 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HMS1	Q12398	434 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	STB3	Q12427	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	STE3	P06783	470 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	WHI2	P12611	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ABF1	P14164	731 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	COQ1	P18900	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SIT4	P20604	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LYP1	P32487	611 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	KAP122	P32767	1081 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PEX2	P32800	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YKL100C	P34248	587 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RIM11	P38615	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YHK8	P38776	514 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ECM10	P39987	644 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FMP10	P40098	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NDE1	P40215	560 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CSM2	P40465	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YKE4	P40544	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HXT9	P40885	567 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YJL016W	P47072	561 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ROM1	P53046	1155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YGR026W	P53217	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ARL3	Q02804	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TVP15	Q03860	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPS7	Q06325	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GSH2	Q08220	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DCN1	Q12395	269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CAP2	P13517	287 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	AEP2	P22136	580 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	AMS1	P22855	1083 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GIT1	P25346	518 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ADP1	P25371	1049 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HYM1	P32464	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PET127	P32606	800 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SKG1	P36169	355 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ERT1	P38140	529 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	APM3	P38153	483 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBL086C	P38177	466 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ALG3	P38179	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	COS111	P38308	924 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPL2	P38839	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DUN1	P39009	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SSO2	P39926	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DOT5	P40553	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ALR2	P43553	858 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CAF16	P43569	289 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NUP85	P46673	744 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CTR1	P49573	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBP2	P53169	641 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CLF1	YLR117C	RMT2	Q03305	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TRM82	Q03774	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SND1	Q04007	877 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SNX41	Q04053	625 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FAR10	Q06001	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YET3	Q07451	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NDE2	Q07500	545 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	AAD15	Q08361	143 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FRE5	Q08908	694 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MLH3	Q12083	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HAT1	Q12341	374 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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