RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	CBK1	P53894	756 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	INA17	Q02888	182 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	FCP1	Q03254	732 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	AFT2	Q08957	416 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	BUG1	Q12191	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	RRI1	Q12468	440 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	PET111	P08468	800 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	GPA1	P08539	472 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	STE50	P25344	346 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YCR006C	P25350	157 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	FMP10	P40098	244 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SLZ1	P40167	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	PCI8	P40512	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	IME4	P41833	600 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SIP4	P46954	829 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	MEP3	P53390	489 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	NKP1	Q12493	238 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	MCM10	P32354	571 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YJR061W	P40355	935 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	PKP1	P40530	394 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	CAC2	Q04199	468 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	ATX2	Q12067	313 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SLM3	Q12093	417 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YPR089W	O13585	888 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	CHO1	P08456	276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	ASK1	P35734	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	ALY1	P36117	915 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	PXL1	P36166	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	BSC5	P53755	489 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	INN1	P53901	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	ESL2	P36168	1195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	UIP3	P39547	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	VID27	P40157	782 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SMC3	P47037	1230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	GLO1	P50107	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YNL144C	P53907	740 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	ASI1	P54074	624 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YKU80	Q04437	629 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	FRE3	Q08905	711 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPT15	YER148W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	CLB2	P24869	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	MGM1	P32266	881 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	TMT1	P32643	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	YPT11	P48559	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	PFA5	Q03289	374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	ATG9	Q12142	997 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	RGT2	Q12300	763 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	ICT1	Q12385	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	SKM1	Q12469	655 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	RAP1	P11938	827 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	YFR020W	P43600	232 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	POS5	Q06892	414 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	GEP3	Q08622	556 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	CDC16	P09798	840 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	PRE8	P23639	250 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	CHS3	P29465	1165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SPT15	YER148W	FLO5	P38894	1075 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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