RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W MSN4P33749 630 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PRX1P34227 261 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MMS4P38257 691 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RRP3P38712 501 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SIP5P40210 489 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W IRC6P43615 237 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FMP33P46998 180 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SDH1Q00711 640 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YLR455WQ06188 304 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YLR173WQ06247 608 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ULA1Q12059 462 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GLO4Q12320 285 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ATG31Q12421 196 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YBL029C-AQ3E756 94 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NCB2Q92317 146 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MTF2P10849 440 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CBP3P21560 335 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DAL81P21657 970 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.13□□□□□ -1.59not detected
CYK3YDL117W MKS1P34072 584 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YKL133CP36066 463 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SKG1P36169 355 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MCM7P38132 845 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YHR182WP38870 785 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YER130CP39959 443 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YAT2P40017 923 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YFL034WP43564 1073 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CWC27Q02770 301 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DLT1Q04216 342 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ERR1P0CX10 437 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ERR2P0CX11 437 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HMG2P12684 1045 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W POL3P15436 1097 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CPR3P25719 182 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RAD54P32863 898 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SRP101P32916 621 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PRP40P33203 583 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MMF1P40185 145 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YGR042WP53227 271 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YNR061CP53747 219 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VPS74Q06385 345 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YEH1Q07804 573 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FEX1Q08913 375 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HFI1Q12060 488 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SRF1Q12516 437 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MAS1P10507 462 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HPR1P17629 752 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W APA2P22108 325 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ADP1P25371 1049 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GSY2P27472 705 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BCK2P33306 851 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CTF13P35203 478 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CSE4P36012 229 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W XDJ1P39102 459 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RRN7P40992 514 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPE1P46969 238 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PAC10P48363 199 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CUL3P53202 744 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FMP48P53233 369 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PRM1P53835 661 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HDA3Q06623 655 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PSR2Q07949 397 aa5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MF(ALPHA)1P01149 165 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TUB3P09734 445 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PET9P18239 318 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PRP9P19736 530 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VPS34P22543 875 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W IFM1P25038 676 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HRR25P29295 494 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ATM1P40416 690 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VHR1P40522 640 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W IMO32P53219 342 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YDR541CQ03049 344 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BCH1Q05029 724 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PIB1Q06651 286 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TRE2Q08693 809 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MLH3Q12083 715 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NTO1Q12311 748 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CYT1P07143 309 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37 ms