RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	GIP4	P39732	760 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MEP1	P40260	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ASG1	P40467	964 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	BTN2	P53286	410 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RSM28	Q03430	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	PCT1	P13259	424 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ADH7	P25377	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AAD3	P25612	363 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	GPI10	P30777	616 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	LHS1	P36016	881 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YMC2	P38087	329 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MIT1	P40002	666 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	DOT5	P40553	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	OPT1	P40897	799 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AVT1	P47082	602 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	KIN4	Q01919	800 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	WAR1	Q03631	944 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RAD33	Q04231	177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	VPS38	Q05919	439 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AVL9	Q12500	764 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	TPK2	P06245	380 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	TRM2	P33753	639 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	UIP3	P39547	235 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	BUR6	P40096	142 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SSU1	P41930	458 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	BOP3	P53958	396 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	CIK1	Q01649	594 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	PCL8	Q08966	492 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ATG29	Q12092	213 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ACF2	Q12168	779 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	TAF3	Q12297	353 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SPT7	P35177	1332 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	GCS1	P35197	352 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
YVC1	YOR087W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	GPI8	P49018	411 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	DIA3	P52290	468 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YGL117W	P53133	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	TIM44	Q01852	431 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	HRD3	Q05787	833 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	REC107	P21651	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	SAS3	P34218	831 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	ECM10	P39987	644 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MUK1	Q02866	612 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	AIM32	Q04689	311 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YVC1	YOR087W	MNE1	P24720	663 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	SEF1	P34228	1148 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	STB6	P36085	766 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	PKP1	P40530	394 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	IRC8	P47046	822 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	TWF1	P53250	332 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	HOT1	Q03213	719 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	FIN1	Q03898	291 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	INP53	Q12271	1107 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	GAL80	P04387	435 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	SYN8	P31377	255 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	CMC1	P36064	111 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	MNN2	P38069	597 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	YIL166C	P40445	542 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	LCB2	P40970	561 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	YFL015C	P43578	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	FAR3	P46671	204 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	PET130	P47065	347 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	EFM6	P53970	246 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	MAK10	Q02197	733 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YVC1	YOR087W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms