RNA–Protein interactions for RNA: YOL082W

ATG19, Transcript of Receptor protein for the cytoplasm-to-vacuole targeting (Cvt) pathway, yeast

Gene ATG19, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG19	YOL082W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	TRM8	Q12009	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	CLB2	P24869	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	PSD1	P39006	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	VPS4	P52917	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	YTP1	P53584	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	GTR1	Q00582	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	VID22	Q05934	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	NUS1	Q12063	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	STV1	P37296	890 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	YNR061C	P53747	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	FMP42	Q04991	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	NDD1	Q08887	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	RPB8	P20436	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	PDR3	P33200	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	IME4	P41833	600 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	YGR021W	P53212	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	NNF2	P53253	936 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	NRT1	Q08485	598 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG19	YOL082W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SLC1	P33333	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	EFM2	P38347	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YND1	P40009	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	HXT9	P40885	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	EDE1	P34216	1381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	MGR1	P25573	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YPK3	P38070	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	PKP1	P40530	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	MAF1	P41910	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	EKI1	Q03764	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	BZZ1	P38822	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RTT107	P38850	1070 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	IAH1	P41734	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SMC3	P47037	1230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	MAK10	Q02197	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RCO1	Q04779	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	TAH18	Q12181	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	HNM1	P19807	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	MRP20	P32387	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RAD24	P32641	659 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YER010C	P40011	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SMA1	Q02651	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	MUB1	Q03162	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	PPZ1	P26570	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	GAC1	P28006	793 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	MIA40	P36046	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SLZ1	P40167	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RTS2	P40962	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RTS3	P53289	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	RSF1	Q05043	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	APL4	Q12028	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	ATG9	Q12142	997 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	NBP2	Q12163	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	INP53	Q12271	1107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YKL050C	P35736	922 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	ALY1	P36117	915 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	FUI1	P38196	639 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	AXL2	P38928	823 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YIL060W	P40519	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	ATG27	P46989	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SNO4	Q04902	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	HSP32	Q08992	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG19	YOL082W	SPE2	P21182	396 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	UIP3	P39547	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	YGL260W	P53056	76 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	CDC23	P16522	626 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	GID7	P25569	745 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	CBF2	P32504	956 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG19	YOL082W	RRN3	P36070	627 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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