RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	GRX4	P32642	244 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	PHO90	P39535	881 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YJL213W	P40896	331 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	AGA1	P32323	725 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	SPC34	P36131	295 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	GEX2	P36173	615 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	PAF1	P38351	445 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	CRN1	Q06440	651 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YEH2	Q07950	538 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	GAC1	P28006	793 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YER130C	P39959	443 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YIL060W	P40519	144 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YBP1	P38315	674 aa		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	IKS1	P47042	667 aa		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	RPM2	Q02773	1202 aa		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	YOL159C	Q08300	171 aa		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	Q0140	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	SPO16	P17122	198 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	PHD1	P36093	366 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ECM10	P39987	644 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ERR3	P42222	437 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	COS10	P52924	374 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	PKP2	P53170	491 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	TEP1	P53916	434 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	YOL114C	Q12322	202 aa		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	AGP2	P38090	596 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	APM3	P38153	483 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RPH1	P39956	796 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	SWP82	P43554	623 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RSM28	Q03430	361 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	VAM6	Q07468	1049 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	SET6	Q12529	373 aa		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ATS1	P31386	333 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ACH1	P32316	526 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	MIA40	P36046	403 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RTT101	P47050	842 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	DOS2	P54858	310 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	FMP45	Q07651	309 aa		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	YFR020W	P43600	232 aa		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	MSS11	Q03825	758 aa		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ARP6	Q12509	438 aa		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	NUP120	P35729	1037 aa		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RPR2	P40571	144 aa		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RBA50	Q04418	439 aa		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	PIF1	P07271	859 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	MRC1	P25588	1096 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	NDC1	P32500	655 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	MTC6	P38849	526 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	SOL4	P53315	255 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RDR1	Q08904	546 aa		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	Q0140	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	HXT1	P32465	570 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	YTA12	P40341	825 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	NNF2	P53253	936 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	TRS130	Q03660	1102 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	ATG26	Q06321	1198 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	ESL2	P36168	1195 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	ARP1	P38696	384 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	AXL1	P40851	1208 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	YGL082W	P53155	381 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	FOL1	P53848	824 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	TYR1	P20049	452 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	YBR138C	P38277	524 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	IDP2	P41939	412 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	CTF18	P49956	741 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	CDC45	Q08032	650 aa		3.19	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	SPC110	P32380	944 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	YEL045C	P32616	141 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	SPC72	P39723	622 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	TGL2	P54857	326 aa		3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
VAR1	Q0140	GRC3	Q07845	632 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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