RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA SMC3P47037 1230 aa3.18□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA ECI1Q05871 280 aa3.18□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.18□□□□□ -1.9not detected
15S_rRNA15S_rRNA KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA CLB2P24869 491 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA UIP3P39547 235 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA PCL6P40038 420 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YFR020WP43600 232 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA AAD10P47182 288 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA CBK1P53894 756 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA INA17Q02888 182 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA DSE3Q08729 430 aa3.17□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA FUM1P08417 488 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YJR061WP40355 935 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YIL152WP40455 235 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA PIL1P53252 339 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YMR018WQ04364 514 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA ARP10Q04549 284 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA SKG3Q06315 1026 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA MCP2Q06567 569 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA MLH2Q07980 695 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YLR112WQ12130 139 aa3.16□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA ALY1P36117 915 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA FMP10P40098 244 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA SIP4P46954 829 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA INN1P53901 409 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA NUP53Q03790 475 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA YLR281CQ05863 155 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA SRL1Q08673 210 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA ATG9Q12142 997 aa3.15□□□□□ -1.9
15S_rRNA15S_rRNA GAC1P28006 793 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA PDB1P32473 366 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YKL050CP35736 922 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA MIA40P36046 403 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA MNN2P38069 597 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA LEU5P38702 357 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA VRG4P40107 337 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA NNF2P53253 936 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YTP1P53584 459 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA BSC5P53755 489 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YNL181WP53878 407 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA IZH1Q03419 316 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA ARP9Q05123 467 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA SNA4Q07549 140 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA APL4Q12028 832 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA INP53Q12271 1107 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA SKM1Q12469 655 aa3.15□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA SPE2P21182 396 aa3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA PRE8P23639 250 aa3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
15S_rRNA15S_rRNA PSR1Q07800 427 aa3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA BUD7Q08754 746 aa3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA NKP1Q12493 238 aa3.14□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA CBP1P07252 654 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YFL068WP0CX99 160 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YLL066W-AP0CY00 160 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YLL067W-AP0CY01 160 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA RPB8P20436 146 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA DPH1P40487 425 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA MAF1P41910 395 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA SGF73P53165 657 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA MEP3P53390 489 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YNL234WP53857 426 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA MAK10Q02197 733 aa3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA MCM10P32354 571 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA STV1P37296 890 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YPK3P38070 525 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA AGP2P38090 596 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA RKM3P38222 552 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA ZDS2P54786 942 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA TCO89Q08921 799 aa3.12□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA VMA16P23968 213 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA YCR043CP25361 127 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA ADH7P25377 361 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA GCS1P35197 352 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA BUR6P40096 142 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA HXT9P40885 567 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA IAH1P41734 238 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA ESBP6P53918 673 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA BET4Q00618 327 aa3.11□□□□□ -1.91
15S_rRNA15S_rRNA ATG26Q06321 1198 aa3.11□□□□□ -1.91
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