RNA–Protein interactions for RNA: YPL166W

ATG29, Transcript of Autophagy-specific protein, yeast

Gene ATG29, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG29	YPL166W	PXL1	P36166	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	UBP13	P38187	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	MRX1	P40050	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	UBP8	P50102	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	YGR021W	P53212	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	GTR1	Q00582	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	FUI1	P38196	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	YIR016W	P40572	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	MDV1	P47025	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	FCP1	Q03254	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	GPA1	P08539	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	SRB5	P32585	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	CNS1	P33313	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	VPS41	P38959	992 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	IML2	P47031	731 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	SWF1	Q04629	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG29	YPL166W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
ATG29	YPL166W	YLR302C	O13544	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	RIC1	P40395	1056 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	SWP82	P43554	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	BNA1	P47096	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	VPS25	P47142	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	REG1	Q00816	1014 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	PFA5	Q03289	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	VID22	Q05934	901 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	FRE3	Q08905	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	TRM8	Q12009	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	PET111	P08468	800 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	ERG8	P24521	451 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	CDC15	P27636	974 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	SLC1	P33333	303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	RSM28	Q03430	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	UBX3	Q12229	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	VCX1	Q99385	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	VPS4	P52917	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	BOP3	P53958	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	POS5	Q06892	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	GSH2	Q08220	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	NUS1	Q12063	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	CHO1	P08456	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	PSD1	P39006	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	ECM10	P39987	644 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	CTK2	P46962	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	CAC2	Q04199	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	ATO2	P32907	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	SNA4	Q07549	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	DSE3	Q08729	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	RAP1	P11938	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	STE50	P25344	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	YER010C	P40011	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	ASI1	P54074	624 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	YML131W	Q03102	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG29	YPL166W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	DPB3	P27344	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	AXL2	P38928	823 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	IME4	P41833	600 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	YNR061C	P53747	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	IZH1	Q03419	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	RCO1	Q04779	684 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	RRN3	P36070	627 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	ESL2	P36168	1195 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	VRG4	P40107	337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	YIL152W	P40455	235 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	YFR020W	P43600	232 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	NUP53	Q03790	475 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	SNO4	Q04902	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG29	YPL166W	ECI1	Q05871	280 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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