RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TUP1	P16649	713 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SIN4	P32259	974 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	NTH1	P32356	751 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PLC1	P32383	869 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	DOM34	P33309	386 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PHO11	P35842	467 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	GMH1	P36125	273 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PHO12	P38693	467 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PCL5	P38794	229 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MTG2	P38860	518 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	STN1	P38960	494 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RPH1	P39956	796 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RIM21	P48565	533 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	FRE4	P53746	719 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YNL108C	P53929	270 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YNL092W	P53934	400 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PEX25	Q02969	394 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CIA1	Q05583	330 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	LDB18	Q07887	179 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	VAC17	P25591	423 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	GSY2	P27472	705 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MCM2	P29469	868 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	AEP1	P32493	518 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ELM1	P32801	640 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SKN1	P33336	771 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	JNM1	P36224	373 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	AIM18	P38884	321 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ERP2	P39704	215 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	LRO1	P40345	661 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RGD2	P43556	714 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HLJ1	P48353	224 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RTS3	P53289	263 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HST1	P53685	503 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	VPS9	P54787	451 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RCO1	Q04779	684 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RSF1	Q05043	376 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CDA1	Q06702	301 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TPO1	Q07824	586 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TMA16	Q08687	178 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TGL5	Q12043	749 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	APC11	Q12157	165 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MMP1	Q12372	583 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CYT1	P07143	309 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SFL1	P20134	766 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YCL042W	P25572	119 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	MEI4	P29467	408 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RRM3	P38766	723 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YHR182W	P38870	785 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ACO2	P39533	789 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	BDH2	P39713	417 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SLX8	P40072	274 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ELO3	P40319	345 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	IRR1	P40541	1150 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	HXT8	P40886	569 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ELP2	P42935	788 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ASK10	P48361	1146 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	TRM9	P49957	279 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SAP4	P53036	818 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	COG1	P53079	417 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ATF2	P53296	535 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	ARP4	P80428	489 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CDC14	Q00684	551 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	FMP45	Q07651	309 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.4	□□□□□ -1.71	not detected
YNL057W	YNL057W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.39	□□□□□ -1.71	not detected
YNL057W	YNL057W	CLN1	P20437	546 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	EMC1	P25574	760 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YCR015C	P25616	317 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	IMG1	P25626	169 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SEC65	P29478	273 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	PSY4	P38193	441 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YHR210C	P38893	341 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YEL073C	P39974	107 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RFX1	P48743	811 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YNL057W	YNL057W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.7 ms