RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MPS1	P54199	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	SWF1	Q04629	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MCH4	Q08268	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	CIR2	Q08822	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ERP4	Q12450	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PET111	P08468	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SMK1	P41808	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	IRC8	P47046	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	YGR021W	P53212	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	RCF1	Q03713	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	CAC2	Q04199	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	COG4	Q06096	861 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	COX17	Q12287	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TPK1	P06244	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SRB5	P32585	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TFC3	P34111	1160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	IFA38	P38286	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	UBP8	P50102	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	STP3	Q05937	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SWA2	Q06677	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	NKP1	Q12493	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PSY4	P38193	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	MUM2	P38236	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	COG1	P53079	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PCD1	Q12524	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	GPA1	P08539	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	STE50	P25344	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	RAD16	P31244	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	MRX1	P40050	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	MDV1	P47025	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	BNA1	P47096	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TCB2	P48231	1178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	VPS4	P52917	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	CRN1	Q06440	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TMA16	Q08687	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	UBX3	Q12229	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	HER1	Q12276	1246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	VCX1	Q99385	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SSM4	P40318	1319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	RPN12	P32496	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	HSP42	Q12329	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	LHS1	P36016	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	UBP13	P38187	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	FLO5	P38894	1075 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PCL6	P40038	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SWP82	P43554	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	YPT11	P48559	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	YNL144C	P53907	740 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	RCO1	Q04779	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	VID22	Q05934	901 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
WSS1	YHR134W	YCR006C	P25350	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	ATO2	P32907	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PXL1	P36166	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	FUI1	P38196	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	YIL152W	P40455	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	CTK2	P46962	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	GTR1	Q00582	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	GRX3	Q03835	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	ECI1	Q05871	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	POS5	Q06892	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	GSH2	Q08220	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WSS1	YHR134W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WSS1	YHR134W	CDC15	P27636	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WSS1	YHR134W	SWI3	P32591	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WSS1	YHR134W	SAS3	P34218	831 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WSS1	YHR134W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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