RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	YDL073W	Q07454	984 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YDL242W	Q07746	117 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YEH1	Q07804	573 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YLR040C	Q07988	224 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BUD7	Q08754	746 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SPE4	Q12455	300 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YPT6	Q99260	215 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GAL80	P04387	435 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	AAC1	P04710	309 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.79	□□□□□ -1.96	not detected
YMR31	YFR049W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PMS1	P14242	873 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	AMD2	P22580	549 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	HCM1	P25364	564 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YIH1	P25637	258 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LAC1	P28496	418 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MRPL9	P31334	269 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	DPH2	P32461	534 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GCS1	P35197	352 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	STB6	P36085	766 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GMH1	P36125	273 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CST26	P38226	397 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	VID24	P38263	362 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SMF1	P38925	575 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LTP1	P40347	161 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ARG2	P40360	574 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MET18	P40469	1032 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.79	□□□□□ -1.96	not detected
YMR31	YFR049W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SGF73	P53165	657 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	COG2	P53271	262 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GYL1	Q04322	720 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ARG7	Q04728	441 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CRT10	Q08226	957 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.79	□□□□□ -1.96	not detected
YMR31	YFR049W	NTO1	Q12311	748 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GRX6	Q12438	231 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YML133C	Q03099	1374 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	REC107	P21651	314 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RNQ1	P25367	405 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ADK2	P26364	225 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GDA1	P32621	518 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LHS1	P36016	881 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GLG1	P36143	616 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YPT10	P38146	199 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ERC1	P38767	581 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CAJ1	P39101	391 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	GIP4	P39732	760 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LAS21	P40367	830 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	NDC80	P40460	691 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ZIM17	P42844	174 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SWP82	P43554	623 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CTK2	P46962	323 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	VID30	P53076	958 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CIK1	Q01649	594 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	IRC3	Q06683	689 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ESC8	Q08119	714 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YOL073C	Q08232	322 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BAG7	Q12128	409 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ZPS1	Q12512	249 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	WHI2	P12611	486 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	STE50	P25344	346 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MDL1	P33310	695 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SEF1	P34228	1148 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HES1	P35843	434 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MNN2	P38069	597 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RXT2	P38255	430 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MET28	P40573	187 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	LCB2	P40970	561 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YJL055W	P47044	245 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MSY1	P48527	492 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	DIA3	P52290	468 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YGR016W	P53209	190 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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