RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	CTF3	Q12748	733 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	BUD4	P47136	1447 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ARG82	P07250	355 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PCK1	P10963	549 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ECM4	P36156	370 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	VID24	P38263	362 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ATG14	P38270	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MSG5	P38590	489 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	GIC1	P38785	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	GPB2	P39717	880 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	LRO1	P40345	661 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YIR014W	P40570	242 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PEF1	P53238	335 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ACS1	Q01574	713 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SRT1	Q03175	343 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	VPS20	Q04272	221 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	BOP2	Q06150	570 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	STP4	Q07351	490 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ECM5	Q03214	1411 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	NFS1	P25374	497 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	AFG1	P32317	509 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MSN4	P33749	630 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SEF1	P34228	1148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	UGA2	P38067	497 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	REV7	P38927	245 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SHR5	P41912	237 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	EFM3	P47163	339 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ASE1	P50275	885 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	VPS4	P52917	437 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MNT4	P53745	580 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SMA1	Q02651	245 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	THI22	Q06490	572 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	GPB1	Q08886	897 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RBD2	Q12270	262 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TAF3	Q12297	353 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SPE4	Q12455	300 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	URA3	P03962	267 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
MDV1	YJL112W	UNG1	P12887	359 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	IME1	P21190	360 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SRB4	P32569	687 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TPO5	P36029	618 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YKR075C	P36155	307 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YAR028W	P39548	234 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	CAB2	P40506	365 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YJL181W	P46987	611 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	LYS5	P50113	272 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YGL242C	P53066	181 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	VID30	P53076	958 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	LCL3	P53153	274 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YGR111W	P53265	400 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	UAF30	Q08747	228 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	APC2	Q12440	853 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	VCX1	Q99385	411 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MDS3	P53094	1487 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PRB1	P09232	635 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ARG1	P22768	420 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PRD1	P25375	712 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.7 ms