RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	UPC2	Q12151	913 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PSY3	Q12318	242 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PNS1	Q12412	539 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SEC39	Q12745	709 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CTF3	Q12748	733 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CHD1	P32657	1468 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CTT1	P06115	562 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	BIK1	P11709	440 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CPR2	P23285	205 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PET127	P32606	800 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SUR1	P33300	382 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ALY1	P36117	915 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	DAD2	P36162	133 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VPS45	P38932	577 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	JHD1	P40034	492 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VFA1	P40080	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GSM1	P42950	618 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	FET5	P43561	622 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	AGX1	P43567	385 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TCB2	P48231	1178 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	KEL2	P50090	882 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VPS4	P52917	437 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	LCL3	P53153	274 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	FDC1	Q03034	503 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ROY1	Q04847	553 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ASM4	Q05166	528 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RXT3	Q07458	294 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TMA16	Q08687	178 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
YHI9	YHR029C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SUL2	Q12325	893 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	FBP1	P09201	348 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PET122	P10355	254 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	HNM1	P19807	563 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	IME1	P21190	360 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YEL043W	P32618	956 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	NIP100	P33420	868 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	HEL1	P36113	551 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MAL33	P38157	468 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	UBP13	P38187	747 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VID24	P38263	362 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SPT8	P38915	602 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	REV7	P38927	245 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SAK1	P38990	1142 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GCD10	P41814	478 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	STU2	P46675	888 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YAP6	Q03935	383 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PPN1	Q04119	674 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	DUS4	Q06063	367 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MCP2	Q06567	569 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SPE1	P08432	466 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	HMG2	P12684	1045 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	CDS1	P38221	457 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	TDP1	P38319	544 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	CTF8	P38877	133 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	MET28	P40573	187 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	AAD10	P47182	288 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	NCS6	P53088	359 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	YBP2	P53169	641 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	COX18	P53239	316 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	TCO89	Q08921	799 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	HER1	Q12276	1246 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	GPR1	Q12361	961 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	KAR3	P17119	729 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	MTC7	P32633	139 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	PCH2	P38126	564 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	ERC1	P38767	581 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	YHR078W	P38799	552 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	SFB3	P38810	929 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHI9	YHR029C	WSS1	P38838	269 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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