RNA–Protein interactions for RNA: YGR239C

PEX21, Transcript of Peroxin required for peroxisomal matrix protein targeting, yeast

Gene PEX21, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX21	YGR239C	YKU80	Q04437	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ATG23	Q06671	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	SWA2	Q06677	668 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	PUS9	Q12069	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YCK1	P23291	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ERC1	P38767	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	BUD16	P39988	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	LAS21	P40367	830 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	UBP7	P40453	1071 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	IME4	P41833	600 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	GND2	P53319	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	CRN1	Q06440	651 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	TCO89	Q08921	799 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	PCL8	Q08966	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	POL4	P25615	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	LAC1	P28496	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	MAL33	P38157	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YBR225W	P38321	900 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	MUP3	P38734	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	SLZ1	P40167	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	DJP1	P40564	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	VTC2	P43585	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	LCL3	P53153	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	MUB1	Q03162	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	TAF3	Q12297	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	GCN4	P03069	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	SRB5	P32585	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YFL015C	P43578	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RMD8	P43620	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	AAD10	P47182	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YAT1	P80235	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	NGL3	Q03210	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	CIR2	Q08822	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	LCB4	Q12246	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	MOH1	P38191	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	REG2	P38232	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
PEX21	YGR239C	MRX6	P48564	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	CPR8	P53728	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YML037C	Q03703	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RAD33	Q04231	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	CTI6	Q08923	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RCN2	Q12044	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	ERP4	Q12450	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX21	YGR239C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	RED1	P14291	827 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	CHS7	P38843	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	CIR1	P42940	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	YJL043W	P47053	257 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	YGL117W	P53133	265 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	INN1	P53901	409 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	ARG3	P05150	338 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	MTH1	P35198	433 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	HES1	P35843	434 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	GEX2	P36173	615 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	DOT5	P40553	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	IRC6	P43615	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	SGM1	P47166	707 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	YNR061C	P53747	219 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	VPS75	P53853	264 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	PSR1	Q07800	427 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	BAG7	Q12128	409 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	MET17	P06106	444 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	CBS1	P14066	229 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	SPO11	P23179	398 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PEX21	YGR239C	VMA16	P23968	213 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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