RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	LIP5	P32875	414 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PHO11	P35842	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PXL1	P36166	706 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MRPL36	P36531	177 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PHO12	P38693	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MET28	P40573	187 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YFL054C	P43549	646 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YKE2	P52553	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MNT2	P53059	558 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ARP5	P53946	755 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MSC3	Q05812	728 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YPS7	Q06325	596 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ICL2	Q12031	575 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RIM20	Q12033	661 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RCN2	Q12044	265 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	CTF3	Q12748	733 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YLR302C	O13544	120 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PET111	P08468	800 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	CLB3	P24870	427 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ACP1	P32463	125 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
SMI1	YGR229C	SLA2	P33338	968 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ECM4	P36156	370 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MSG5	P38590	489 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YHL017W	P38745	532 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PIH1	P38768	344 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YIL089W	P40500	205 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
SMI1	YGR229C	YIR014W	P40570	242 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	BST1	P43571	1029 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YJL045W	P47052	634 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ASE1	P50275	885 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	COG1	P53079	417 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	LCL3	P53153	274 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ORC4	P54791	529 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MAK10	Q02197	733 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PEX19	Q07418	342 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	AAD4	Q07747	329 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RSB1	Q08417	382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	TRE1	Q08919	783 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	TCO89	Q08921	799 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	UBX3	Q12229	455 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	APC2	Q12440	853 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YME1	P32795	747 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YBL029W	P38201	376 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YHL012W	P38709	493 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	STN1	P38960	494 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YIL077C	P40508	320 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	DOT5	P40553	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	CHS6	P40955	746 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PXA1	P41909	870 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	IMA1	P53051	589 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MLC1	P53141	149 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	REG1	Q00816	1014 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	SWT1	Q12104	458 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	RBD2	Q12270	262 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	GIS3	Q12418	502 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	URA3	P03962	267 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	BIK1	P11709	440 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	VPS3	P23643	1011 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ERG8	P24521	451 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YSC84	P32793	468 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	KDX1	P36005	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	UGA2	P38067	497 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	JHD1	P40034	492 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	YER158C	P40095	573 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	AVT1	P47082	602 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SMI1	YGR229C	GLO1	P50107	326 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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