RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	BLS1	Q06071	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	PDR8	Q06149	701 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	PCD1	Q12524	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YCR006C	P25350	157 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YCL049C	P25577	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	NUP120	P35729	1037 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	ASK1	P35734	292 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	MRPL36	P36531	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	ARN1	P38731	627 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	TPM2	P40414	161 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	DJP1	P40564	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YIR016W	P40572	265 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	CDC1	P40986	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YPT11	P48559	417 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	SWT1	Q12104	458 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
RSM27	YGR215W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	TPK1	P06244	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	CNA1	P23287	553 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YSP3	P25036	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	EXO84	P38261	753 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	IFA38	P38286	347 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	COG1	P53079	417 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	SWA2	Q06677	668 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	PCT1	P13259	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	SPC97	P38863	823 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	ATG23	Q06671	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	MCH4	Q08268	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	CIR2	Q08822	631 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	BAG7	Q12128	409 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RSM27	YGR215W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	MGM1	P32266	881 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	OCT1	P35999	772 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	UBP13	P38187	747 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	ASG1	P40467	964 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	SMK1	P41808	388 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TMA16	Q08687	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	GPA1	P08539	472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	RAD16	P31244	790 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	MDV1	P47025	714 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	CRN1	Q06440	651 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	ATX2	Q12067	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	SPO16	P17122	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	NPR3	P38742	1146 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	IRC8	P47046	822 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	VTC3	Q02725	835 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	SNA4	Q07549	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	FRE3	Q08905	711 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	MTF2	P10849	440 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	PTH2	P34222	208 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	GEX2	P36173	615 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	VPS41	P38959	992 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	SAP185	P40856	1058 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	VPS25	P47142	202 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	ASE1	P50275	885 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	FCP1	Q03254	732 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	PFA5	Q03289	374 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	PIG1	Q06216	648 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	LHS1	P36016	881 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	PXL1	P36166	706 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	UBP8	P50102	471 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	REG1	Q00816	1014 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RSM27	YGR215W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
RSM27	YGR215W	ATO2	P32907	282 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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