RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W REV7P38927 245 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PSD1P39006 500 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CAJ1P39101 391 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YJL206CP39529 758 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W FMP52P40008 231 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SLZ1P40167 298 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W JEM1P40358 645 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YJL068CP40363 299 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PFK26P40433 827 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W UBC11P52492 156 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NNF2P53253 936 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W VPS9P54787 451 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MEH1Q02205 184 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MUB1Q03162 620 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ATG23Q06671 453 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PSK2Q08217 1101 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W TMA16Q08687 178 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CIR2Q08822 631 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CBS1P14066 229 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PMS1P14242 873 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W LRE1P25579 583 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W URK1P27515 501 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PEP3P27801 918 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ALY1P36117 915 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RTS1P38903 757 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W GAT1P43574 510 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W DSD1P53095 428 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ZDS2P54786 942 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NGL3Q03210 505 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YDR131CQ03899 556 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CRF1Q04930 467 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W IZH3Q07959 543 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YBR255C-AQ3E776 120 aa3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RTT105YER104W KAR3P17119 729 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PDE1P22434 369 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W DMC1P25453 334 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ANP1P32629 500 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YKL100CP34248 587 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W GEX2P36173 615 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MRPL7P36519 292 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.28□□□□□ -1.88not detected
RTT105YER104W BUD16P39988 312 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W STB2P46679 850 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MPS3P47069 682 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YGR016WP53209 190 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PIL1P53252 339 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YNR061CP53747 219 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W INN1P53901 409 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RMT2Q03305 412 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W GTB1Q04924 702 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SWT1Q12104 458 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ISA2Q12425 185 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W GRX6Q12438 231 aa3.28□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SIR3P06701 978 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W SES1P07284 462 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W ABF1P14164 731 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W KES1P35844 434 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W UBP11P36026 717 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W CTP1P38152 299 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W SRO77P38163 1010 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W REG2P38232 338 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W SDH8P38345 138 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W RGI2P40188 164 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W YIL166CP40445 542 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W MET18P40469 1032 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W YGR066CP53242 292 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W CIK1Q01649 594 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W YML119WQ03208 357 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W USA1Q03714 838 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W STP3Q05937 343 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W TCO89Q08921 799 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W YJR112W-AQ3E743 109 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.27□□□□□ -1.89
RTT105YER104W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
RTT105YER104W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W CLB3P24870 427 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W ADY2P25613 283 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W FUB1P25659 250 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W CDC15P27636 974 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W SRB5P32585 307 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W ORC2P32833 620 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W PHO11P35842 467 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W UBP13P38187 747 aa3.26□□□□□ -1.89
RTT105YER104W PHO12P38693 467 aa3.26□□□□□ -1.89
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