RNA–Protein interactions for RNA: YDL093W

PMT5, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT5	YDL093W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
PMT5	YDL093W	TY2A-B	Q12260	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YCK1	P23291	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	GEX2	P36173	615 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SIF2	P38262	535 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SIC1	P38634	284 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YEL057C	P39983	233 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	BUD16	P39988	312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RPN14	P53196	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YNR061C	P53747	219 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YNR068C	P53754	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TOF1	P53840	1238 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PPN1	Q04119	674 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	GTB1	Q04924	702 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	UPC2	Q12151	913 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SOD2	P00447	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SPE1	P08432	466 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PRP28	P23394	588 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	UBP13	P38187	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YHR112C	P38716	378 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	CTM1	P38818	585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
PMT5	YDL093W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SNF12	P53628	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	MCM21	Q06675	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	OCA4	P25366	362 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	OSW5	P40219	148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
PMT5	YDL093W	NUP84	P52891	726 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	JJJ1	P53863	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	REC102	Q02721	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RAD30	Q04049	632 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	HUA2	Q12134	243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	NBP2	Q12163	236 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PSY3	Q12318	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YOR111W	Q99210	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	VCX1	Q99385	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	MRPL25	P23369	157 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RSC6	P25632	483 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ATG19	P35193	415 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PZF1	P39933	429 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	FTR1	P40088	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	MND2	P40577	368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	MMM1	P41800	426 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	FET5	P43561	622 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	JJJ3	P47138	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	VPS4	P52917	437 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ATG21	Q02887	496 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RRN5	Q02983	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RBA50	Q04418	439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	RSF1	Q05043	376 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PSK1	P31374	1356 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YLR302C	O13544	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	AIM26	P32858	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	PCH2	P38126	564 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ECM1	P39715	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	THI6	P41835	540 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	BUD9	P53226	547 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	TAM41	P53230	385 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	EOS1	P53938	366 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	AIM32	Q04689	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ISN1	Q99312	450 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	YRF1-6	P53819	1859 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	CTT1	P06115	562 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ERG8	P24521	451 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	SRO77	P38163	1010 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMT5	YDL093W	MSS4	P38994	779 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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